The use of dark septate fungi (DSE) to promote plant growth can be beneficial to agriculture, and these organisms are important allies in the search for sustainable agriculture practices. This study investigates the contribution of dark septate fungi to the absorption of nutrients by rice plants and their ensuing growth. Four dark septate fungi isolates that were identified by Internal transcribed spacer phylogeny were inoculated in rice seeds (Cv. Piauí). The resulting root colonization was estimated and the kinetic parameters Vmax and Km were calculated from the nitrate contents of the nutrient solution. The macronutrient levels in the shoots, and the NO3−-N, NH4+-N, free amino-N and soluble sugars in the roots, sheathes and leaves were measured. The rice roots were significantly colonized by all of the fungi, but in particular, isolate A103 increased the fresh and dry biomass of the shoots and the number of tillers per plant, amino-N, and soluble sugars as well as the N, P, K, Mg and S contents in comparison with the control treatment. When inoculated with isolates A103 and A101, the plants presented lower Km values, indicating affinity increases for NO3−-N absorption. Therefore, the A103 Pleosporales fungus presented the highest potential for the promotion of rice plant growth, increasing the tillering and nutrients uptake, especially N (due to an enhanced affinity for N uptake) and P.

Resumo -O objetivo deste trabalho foi avaliar a ocorrência de fungos endofíticos "dark septate" (DSEF) em Oryza glumaepatula, na Amazônia, e sua capacidade de colonização in vitro. Foram coletadas plantas de O. glumaepatula em área de cerrado e de mata em Roraima. As raízes foram tratadas para a observação de hifas melanizadas septadas e de microescleródios. Os fungos foram isolados em meio ágar malte. Os DSEF foram observados em plantas coletadas em ambos os ambientes, com maior colonização nas coletadas da mata. Um isolado foi capaz de colonizar o hospedeiro original e também plantas de Oryza sativa, exibindo as estruturas características de DSEF em plantas de arroz saudáveis.Termos para indexação: Oryza sativa, arroz silvestre, micossimbionte. Occurrence of dark septate endophyte fungi in Oryza glumaepatula roots in AmazoniaAbstract -The objective of this work was to assess the occurrence of dark septate endophyte fungi (DSEF) in Oryza glumaepatula in Amazonia, and its in vitro colonization capacity. Oryza glumaepatula plants were collected in forest and cerrado areas of the Roraima state, Brazil. The roots were prepared to observe septate melanized hyphas and microesclerotia. The isolation of fungi was done in agar malte medium. Dark septate endophyte fungi were observed in plants from both environments, with higher colonization on those collected in the forest. One isolate was able to colonize the original host and also Oryza sativa plants, exhibiting typical DSEF structures in rice healthy plants.Index terms: Oryza sativa, wild rice, mycossimbiont.Oryza glumaepatula Steud. é uma espécie de arroz silvestre que ocorre no Pantanal Mato-grossense, no Planalto Central e em áreas de várzea da Amazônia (Rangel et al., 2006). A abundante produção de biomassa de plantas sadias em ambientes oligotróficos, em várzeas da Amazônia, indica que essa espécie é capaz de estabelecer associações mutualistas com microrganismos que auxiliam o seu estabelecimento e desenvolvimento.Recentemente, a associação entre espécies de arroz silvestre com bactérias diazotróficas (Zhang et al., 2008) e fungos endofíticos "dark septate" (DSEF) (Yuan et al., 2010) foi relatada. Alguns autores têm sugerido que os DSEF são capazes de estabelecer associações mutualistas com seus hospedeiros, pois atuam como promotores do crescimento vegetal e, principalmente, facilitam a absorção de fósforo e nitrogênio (Chen et al., 2010). Também tem sido observado que os DSEF podem coexistir com fungos micorrízicos e produzir metabólitos capazes de aumentar a germinação, o crescimento e a ramificação de hifas desses fungos, beneficiando a planta hospedeira de forma indireta (Scervino et al., 2009). Porém, diferentemente de fungos micorrízicos arbusculares, os DSEF não são biotróficos obrigatórios, o que facilita seu cultivo em meio de cultura e o desenvolvimento de inoculantes que visem à promoção do crescimento vegetal.

Resumo -Os fungos endofíticos conhecidos como DSEF ou "dark septate" podem ser promotores de crescimento vegetal. Com o objetivo de aperfeiçoar uma metodologia para o isolamento, armazenamento e determinação da colonização de raízes de arroz por fungos "dark septate" desenvolveu-se um estudo a partir da obtenção destes microrganismos em plantas de Oryza glumaepatula coletadas em ambientes amazônicos. As raízes das plantas de doze amostras de O. glumaepatula foram seccionadas, desinfestadas e dispostas em placas com o meio ágar-malte adicionado de cloranfenicol, sulfametazol e trimetropina. Os isolados obtidos foram avaliados quanto às características de "dark septate" e armazenados em água destilada com e sem a adição de glicerol. Cinco isolados fúngicos considerados "dark septate" foram reinoculados em plantas de O. glumaepatula e em O. sativa e, também, caracterizados molecularmente através da amplificação e sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2. O meio de cultura ágar-malte foi eficiente para a obtenção de "dark septate", obtendo-se mais de 50 isolados. O armazenamento em água destilada e em água destilada adicionada de glicerol mostrou-se eficiente para a manutenção das culturas fúngicas por pelo menos 12 meses. Os cinco isolados fúngicos reinoculados foram capazes de colonizar tanto raízes O. glumaepatula quanto O. sativa, não desencadeando sintomas de patogenicidade. A análise molecular mostrou que estes fungos apresentam baixa similaridade entre eles e não possuem similaridade com fungos "dark septate" já descritos, indicando que a metodologia empregada permitiu a obtenção de espécies fúngicas diversas e que a espécie O. glumaepatula abriga alta diversidade deste grupo de fungos. Palavras-Chave -Amazônia. DSEF. Oryza glumaepatula. Oryza sativa.Abstract -Endophyte fungi known as DSEF can be plant-growth-promoting. Aiming to improve a methodology for the isolation, storage and determine the rice roots colonization by "dark septate", a study was developed based on the achievement of these microorganisms in Oryza glumaepatula plants collected in Amazon region. The plant roots of twelve O. glumaepatula samples were sectioned, disinfected, and placed in plates with agar-malte medium added of chloramphenicol, sulphametazole and trimetropin. The isolates were evaluated in relation of dark septate characteristics and stored in distilled water, and in distilled water added of glycerol. Five isolates considered dark septate were re-inoculated in O. glumaepatula and O. sativa, and also analyzed through amplification and sequencing of ITS1-5.8S-ITS2 region. The agar-malte medium was efficient to isolate dark septate, and more than 50 isolates were obtained. The distilled water and also distilled water added of glycerol were efficient to maintain the fungus culture at least 12 months. The five isolates re-inoculated were able to colonize both O. glumaepatula and O. sativa, without pathogenic symptoms observed. The molecular approach reveled that these fungus are not similar to each other and also to others dark septa...

No abstract

Five strains of a novel yeast species were isolated from rotting wood samples collected in an Amazonian forest site in the state of Roraima, northern Brazil. The sequences of the D1/D2 domains of the large subunit of the rRNA gene showed that this species belongs to the Scheffersomyces clade and is related to Candida coipomoensis, Candida lignicola and Candida queiroziae. The novel species Candida amazonensis sp. nov. is proposed to accommodate these isolates. The type strain of C. amazonensis sp. nov. is UFMG-HMD-26.3T ( = CBS 12363T = NRRL Y-48762T).