El objetivo de este trabajo fue estimar la brecha en los costos de las unidades de producción que implementan buenas prácticas agrícolas (BPA) en la producción de cebolla y las que no, en dos de los principales estados productores de esta hortaliza en México a través de un análisis de costos y la construcción de unidades representativas de producción (URP), con el propósito de contribuir al desarrollo de estrategias para impulsar la adopción de protocolos de buenas prácticas agrícolas (BPA) entre los pequeños y medianos productores de cebolla.. Los resultados evidencian que las URP que cuentan con certificación en BPA son más grandes, tienen mayores rendimientos, incurren en costos fijos unitarios ($.t-1) más altos y costos variables más bajos en comparación con las URP que no cuentan con certificación en BPA; estos parámetros le permiten, a las URP certificadas, recuperar hasta 2.25 pesos por cada peso que invierten, mientras que las URP que no cuentan con certificación recuperan 16 centavos. El apoyo para la certificación en BPA podría ayudar a los agricultores relativamente pobres a acceder de manera rentable a los mercados de exportación, proporcionando así una estrategia de desarrollo para algunos segmentos de la población rural.