O modelo insustentável de uso e ocupação do solo no Cerrado tem ameaçado o equilíbrio dos ciclos biogeoquímicos, biodiversidade e serviços ecossistêmicos. Expansão urbana e atividades agropecuárias e agroindústrias são os principais causadores de poluição difusa em corpos hídricos. O presente trabalho tem como área de estudo o Município de Coxim-MS, ecótono entre Cerrado e Pantanal. Assim, o objetivo dos pesquisadores deste trabalho foi avaliar a influência da área urbana do Município de Coxim, Estado do Mato Grosso do Sul, Brasil, sobre a qualidade da água do Rio Taquari. Foram realizadas coletas de água e análises físicas e químicas em cinco datas, nos meses de novembro de 2017 e fevereiro, abril, junho e agosto de 2018. Foram selecionados três pontos, dois à montante da área urbana e um à jusante, após a confluência dos rios. Foram aplicadas análises estatísticas descritivas e inferenciais, aplicando o método de análise multivariada de análise de componentes principais. As duas primeiras componentes explicaram 68% das variações. Foi possível perceber maior variação significativa entre os pontos durante a estação de seca. Conclui-se que a área urbana tem influência entre pH e alcalinidade, principalmente, e que existe diferença entre os corpos hídricos estudados quanto a variáveis de OD, pH, alcalinidade e dureza. No período da seca estas diferenças são mais visíveis.