Como una de las posibles medidas de manejo de aplicación práctica para la reducción de inóculo de Spongospora subterranea f. sp. subterranea en suelos infestados con quistosoros del patógeno, se evaluó la incidencia de su infección en diferentes plantas hospederas durante tres siembras consecutivas. Las siembras se realizaron en macetas que contenían 2 kg de suelo previamente inoculados con una concentración de 1x105 quistosoros.g-1 de suelo; las cosechas de las plantas se realizaron cada tres meses, seleccionando dos muestras de raíz por maceta, una para observación de estructuras del patógeno por microscopía de luz, previa tinción con azul de tripano al 0,05% y otra para detección molecular mediante PCR en tiempo real (qPCR). Para el análisis estadístico se evaluaron los modelos Exponencial y Monomolecular, con el objetivo de seleccionar el que mejor se ajustara a los datos obtenidos. Según el valor estimado para la incidencia de estructuras del patógeno en las raíces, en las especies Cyphomandra betacea, Physalis peruvianum, Solanum nigrum, Allium cepa, Solanum quitoense y Rumex crispus, se reduce la presencia de quistosoros y zoosporangios después de tres siembras consecutivas en condiciones de casa de malla, mientras que en las especies Petroselinum crispum, Pennisetum clandestinum, Zea mays y Solanum lycopersicum se aumenta la incidencia de estructuras de S. subterranea f. sp. subterranea en las raíces.

En esta investigación se compararon dos métodos de detección de <em>Spongospora Aterranea </em>f. sp. <em>subte­rranea </em>en raíces de plantas hospederas, mediante observación microscópica y PCR en tiempo real (qPCR). Para esto, se evaluaron 20 especies vegetales que fueron inoculadas con una concentración de 1,25x105 quistosoros.g-1 de suelo. Fue obtenida una muestra de raíz tres meses después de inoculación para determi­nar la presencia de estructuras morfológicas mediante dos metodologías: microscopía de luz previa tinción con azul de tripano y qPCR usando el sistema Taqman con los cebadores SponF y SponR y la sonda especí­fica SponP. Estos cebadores amplifican un fragmento de 138 pb de la región ITS2 del ADN ribosomal. Para cuantificar la concentración de quistosoros en los tejidos evaluados, se realizó una curva estándar a partir de diluciones seriadas de 1,25x107 to 1,25x103 cystosori.mL-1, y se estimó el valor del ciclo umbral (Ct) para cada muestra desconocida con relación a la curva estándar. Finalmente, se analizaron los datos con el coeficiente de Kappa para determinar el grado de concordancia entre ambos métodos. Se encontró que los métodos utilizados presentaron un grado de acuerdo leve (0.19) en la detección e identificación de <em>S. subterranea </em>f. sp. <em>subterranea </em>en raíces de diversas plantas hospederas.