INTRODUÇÃO: A diabetes é um problema de saúde pública devido a sua alta prevalência, morbidade e mortalidade. O tipo 2 é mais prevalente e representa de 90 a 95% dos casos, sendo as complicações mais comuns o acúmulo de gordura no músculo esquelético e a resistência à insulina. O exercício físico regular contribui para regulação da glicemia, destacando-se o limiar anaeróbio como importante marcador para prescrição de exercícios físicos. OBJETIVO: Avaliar o limiar anaeróbio de indivíduos com diabetes tipo 2 através da variabilidade da frequência cardíaca. MATERIAIS E MÉTODOS: Estudo de caráter transversal, recrutou 18 participantes de ambos os sexos em uma unidade básica de saúde do município de Lagarto-SE, esse foram divididos em 2 grupos de 9 indivíduos. Na análise estatística utilizou-se o teste de Shapiro-Wilk para avaliação da normalidade e posteriormente Anova com pós teste de Tukey para comparação dos grupos. O grupo 1 composto de indivíduos diabéticos tipo 2 e o grupo 2 de indivíduos saudáveis. Também foi avaliada a média da frequência cardíaca em repouso e após o teste de esforço progressivo. RESULTADOS: As características de idade foram homogêneas sendo o grupo 1 com média de 62,1 (±13,9) anos e grupo 2 de 62,0 (±7,0) anos. A média da frequência de repouso foi de 79,8 bpm do grupo diabéticos e 78 bpm do grupo comparação, no limiar anaeróbio foi de 111,5 no grupo 1 e 119 no grupo 2. O tempo para atingir o L.A foi similar entre os grupos, 9,5 min no grupo experimental e 8 min no grupo comparação. CONCLUSÃO: Os valores do limiar anaeróbio de ambos os grupos foram considerados de baixo condicionamento físico, estes não apresentaram diferença estatística.