Introduction l´implémentation du dépistage néonatal de la drépanocytose pendant la pandémie de coronavirus (COVID-19) représente un défi majeur en République Démocratique du Congo (RDC). La présente étude vise à déterminer si des facteurs socio-économiques sont associés à l´acceptabilité du dépistage néonatal de la drépanocytose pendant la COVID-19 à Kisangani, en RDC. Méthodes étude observationnelle conduite dans les maternités de Kisangani du 21 mars au 30 juin 2020 chez les mères sensibilisées au dépistage néonatal de la drépanocytose de leurs nouveau-nés à l´hemotypeSC TM (HT401RUO-USA). Les données recueillies étaient la parité, le niveau d´étude, l´âge, le niveau socio-économique, la profession, la notion de sensibilisation et le motif du refus du dépistage. Résultats sur 55,5% (273/492) des mères sensibilisées, 107 (39,19 %) ont accepté et 166 (60,80 %) ont refusé le dépistage néonatal de la drépanocytose chez leur nouveau-né. Les motifs du refus étaient l´absence d´information (67,5%; IC 95% [59,8-74,5]), le manque d´argent dû au confinement (66,3%; IC 95% [58,5-73,4]), la prise de sang pour tentative du vaccin anti-COVID-19 (63,2%; IC 95% = [55,4-70,6]). Les facteurs associés à l´acceptabilité du dépistage étaient l´âge > 35 ans (p = 0,0009; ORa = 3,04; IC 95% = 1,57-5,87) et le bas niveau socio-économique (p = 0,0016; ORa = 2,29; IC à 95% = 1,37-3,85). Conclusion l´acceptabilité du dépistage néonatal de la drépanocytose pendant la COVID-19 reste faible à Kisangani. Le gouvernement devrait identifier les canaux de communication efficaces afin de promouvoir les initiatives dans le secteur de la Santé.