A nivel mundial, la producción de jitomate y chile es de gran relevancia. Recientemente, en Israel y Jordania se notificó la presencia de un nuevo miembro del género Tobamovirus en plantaciones de jitomate, al cual se le llamó Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV). Los frutos de plantas infectadas manifiestan áreas amarillas, necróticas o de color marrón incluso rugosidades. En los municipios de Yurécuaro y Tanhuato, Michoacán, se han observado cultivos de jitomate y chile con síntomas similares a los antes mencionados por lo que, el objetivo del presente trabajo fue determinar si el ToBRFV se encuentra presente en estas localidades. Se colectó tejido foliar de jitomate con síntomas y se realizó RT-PCR con iniciadores que amplifican un segmento del ORF2 del genoma de este virus; además, se prepararon rejillas para su observación al microscopio electrónico de transmisión (MET). Se obtuvo el amplicón esperado y las secuencias tuvieron una similitud de 99 a 100 % con ToBRFV. Al MET se observaron partículas virales en forma de varilla rígida típicas de tobamovirus. Hasta donde sabemos este es el primer reporte de la presencia del ToBRFV asociado a plantas de jitomate y chile cultivados en México.
En la actualidad es de importancia estratégica contar con herramientas de diagnóstico rápido y preciso que permitan conocer si el material de interés está infectado con algún virus de importancia cuarentenaria o económica. Por tal motivo, en el presente trabajo se diseñó un par de oligonucleótidos específicos para la detección del ToBRFV por RT-PCR, considerando una región de la secuencia codificante de la RdRP localizada en el ORF1 y la metodología para detectarlo fue estandarizada. Adicionalmente, los amplicones fueron clonados y secuenciados, los productos fueron usados para predecir la relación evolutiva entre ToMMV, ToMV, TMV y ToBRFV por el método <em>Maximum Likelihood</em>. Los resultados indicaron que los oligonucleótidos diseñados en el presenté trabajo permiten la identificación de manera rápida y específica del ToBRFV.
The zygomycete fungus Lichtheimia ramosa H71D, isolated from sugarcane bagasse compost, was identified by applying phylogenetic analysis based on the DNA sequence of the Internal Transcribed Spacer (ITS), and subsequent secondary structure analysis of ITS2. L. ramosa H71D was able to grow over a wide range of temperatures (25–45 °C), manifesting optimal growth at 37 °C. A 64 kDa xylanase (named LrXynA) was purified from the culture supernatant of L. ramosa H71D grown on 2% carboxymethylcellulose (CMC), as the only carbon source. LrXynA displayed optimal activity at pH 6 and temperature of 65 °C. The enzyme retained more than 50% of its maximal activity over a broad range of pH values (4.5–7.5). Enzyme half-life (t½) times at 55, 65 and 75 °C were 80, 25, and 8 min, respectively. LrXynA showed higher affinity (k
M of 2.87 mg/mL) and catalytic efficiency (k
cat/k
M of 0.651 mg s/mL) towards Beechwood xylan in comparison to other substrates such as Birchwood xylan, Oat-spelt xylan, CMC, Avicel and Solka floc. The predominant final products from LrXynA-mediated hydrolysis of Beechwood xylan were xylobiose and xylotriose, suggesting that the enzyme is an endo-β-1,4 xylanase. Scanning electron microscopy (SEM) imaging of sugar cane bagasse (SCB) treated with LrXynA, alone or in combination with commercial cellulases, showed a positive effect on the hydrolysis of SCB. To our knowledge, this is the first report focusing on the biochemical and functional characterization of an endo-β-1,4 xylanase from the thermotolerant and fast-growing fungus Lichtheimia ramosa.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.