We determined in this study the habitat preferences of seven native fish species in a regulated river in Southeastern Brazil. We tested the hypothesis that fishes differ in habitat preference and that they use stretches of the river differing in hydraulic characteristics and substrate type. We surveyed fishes in four 1-km long river stretches encompassing different habitat traits, where we also measured water depth, velocity, and substrate type. We investigated preference patterns of four Siluriformes (Loricariichthys castaneus, Hoplosternum littorale, Pimelodus maculatus, and Trachelyopterus striatulus) and three Characiformes (Astyanax aff. bimaculatus, Oligosarcus hepsetus, and Hoplias malabaricus), representing approximately 70% of the total number of fishes and 64% of the total biomass. We classified fishes into four habitat guilds: (1) a slow-flowing water guild that occupied mud-sand substrate, composed of two Siluriformes in either shallow (< 4 m, i.e., H. littorale) or deep (> 8 m, L. castaneus) waters; (2) a run-dwelling guild that occurs in deep backwaters with clay-mud substrate, composed of the Characiformes A. aff. bimaculatus and O. hepsetus; (3) a run-dwelling guild that occurs in sandy and shallow substrate, composed of T. striatulus; and (4) a fast-flowing guild that occurs primarily along shorelines with shallow mud bottoms, composed of H. malabaricus and P. maculatus. Our hypothesis was confirmed, as different habitat preferences by fishes appear to occur in this regulated river.Determinamos neste estudo a preferência de habitat de sete espécies de peixes abundantes em um rio regulado do Sudeste do Brasil. Testamos a hipótese de que peixes diferem na preferência de habitat e usam trechos do rio com diferentes características hidráulicas e tipos de substratos. Realizamos amostragens de peixes, utilizando redes de espera e tarrafas em quatro trechos do rio de 1 km de extensão, compreendendo diferentes características do habitat, onde também obtivemos medidas de profundidade, velocidade da água e tipo de substrato. Quatro Siluriformes (Loricariichthys castaneus, Hoplosternum littorale, Pimelodus maculatus e Trachelyopterus striatulus) e três Characiformes (Astyanax aff. bimaculatus, Oligosarcus hepsetus e Hoplias malabaricus) que juntos compreenderam aproximadamente 70% do número total e 64% do peso total de peixes foram estudados. Classificamos os peixes em quatro guildas: (1) peixes que ocorrem em trechos com baixa velocidade de fluxo e substrato constituído predominantemente de lama e areia, compreendendo dois Siluriformes, um de áreas rasas (< 4 m, i.e., H. littorale) e outro de áreas profundas (> 8 m, i.e., L. castaneus); (2) peixes que utilizam rápidos de áreas laterais mais profundas com substrato lamoso, representados pelos pequenos Characiformes, A. aff. bimaculatus e O. hepsetus; (3) peixes que utilizam rápidos que ocorrem em áreas rasas e substrato arenoso, representado por T. striatulus; e (4) peixes de corredeiras que utilizam as margens rasas com fundo lamoso, representados por H. ...

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