En el presente trabajo se muestra la comparación realizada del método de Perfilometría por Transformada de Fourier. Utilizando en primer lugar laTrasformada de Fourier Unidimensional y posteriormente la Transformada de Fourier Bidimensional, ambas propuestas son utilizadas para la digitalización de objetos, teniendo variaciones principalmente en la etapa del filtrado de la frecuencia espacial, así como la forma de aplicar dicho filtro a la escena capturada. Se presentan los resultados de tres objetos analizados, el primero es un objeto virtual, con el cual se compara el funcionamiento de ambos métodos, posteriormente se realiza la comparación de dos objetos reales; en todos los resultados se utiliza el desdoblamiento de fase sencillo para su representación 3D, y a partir de los mismos se concluye que el método con la Transformada de Fourier Bidimensional obtiene mejores resultados ya que al realizar un análisis cualitativo estos presentan menores discontinuidades.