Este artigo analisa a geração de ciência para o enfrentamento da covid-19 no Brasil, por gênero, a partir de projetos aprovados para o financiamento por algumas Fundações de Amparo à Pesquisa e pelo Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), no período de 2020 a 2022, bem como a publicação de artigos. O mapeamento evidencia a capacidade das instituições públicas de pesquisa a responderem aos desafios nacionais em diversas áreas do conhecimento e explicita a natureza multifacetada e multidisciplinar da pandemia de covid-19, cujo impacto foi pervasivo em várias áreas da sociedade. Os resultados indicam que as desigualdades de gênero foram acentuadas na pandemia no que se refere à geração de ciência no país, seja na publicação de artigos ou na proposição de projetos direcionados à covid-19. Indicam também uma menor participação das mulheres em temáticas da linha de frente da covid-19, como diagnóstico e prevenção, e maior participação em temáticas relevantes, mas que só foram objeto de análise em um segundo momento, quando o enfretamento da covid-19 permitiu considerar outras dimensões e impactos da crise.