As clinical laboratories transition to using culture-independent detection test (CIDT) panels for cases of acute gastroenteritis, culture of clinical specimens is becoming less common. The reduction in bacterial cultures available for public health activities is expected to hinder surveillance and outbreak response by public health laboratories at the local, provincial, national and international levels. These recommendations are intended to serve as guidelines for the implementation of CIDT panels in frontline laboratories in Canada. The United States of America has already seen a significant reduction in culture of stool specimens despite the Association of Public Health Laboratories recommendation to perform reflex culture on positive CIDT specimens. Priority public health organisms addressed in these Canadian guidelines include Shiga toxin-producing Escherichia coli, Shigella and Salmonella and, under regional circumstances, other organisms such as Campylobacter jejuni/coli and Yersinia enterocolitica. These recommendations suggest active engagement between primary diagnostic laboratories and provincial public health laboratories to determine the workflow and protocols for reflex or parallel culture. Consequently, notifiable disease definitions will also need modification, with consultation of all stakeholders. Stakeholders need to work together to enhance recovery of bacterial isolates with best practices used for stool transport and storage.Affiliations

Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) are important enteric pathogens responsible for sporadic cases and outbreaks of gastroenteritis. E.coli O157:H7/NM (STEC O157) are the most commonly known STEC serotypes but it is now increasingly apparent that non-O157 STEC serotypes have been underreported in the past because they were not part of routine screening in many front-line laboratories. The Canadian Public Health Laboratory Network (CPHLN) has identified the need for improved detection and surveillance of non-O157 STEC and has developed the following recommendations to assist in the decision-making process for clinical and reference microbiology laboratories. These recommendations should be followed to the best of a laboratory's abilities based on the availability of technology and resources.The CPHLN recommends that when screening for the agents of bacterial gastroenteritis from a stool sample, front-line laboratories use either a chromogenic agar culture or a culture-independent diagnostic test (CIDT). CIDT options include nucleic acid amplification tests (NAATs) to detect Shiga toxin genes or enzyme immunoassays (EIAs) to detect Shiga toxins. If either CIDT method is positive for possible STEC, laboratories must have a mechanism to culture and isolate STEC in order to support both provincial and national surveillance as well as outbreak investigations and response. These CPHLN recommendations should result in improved detection of STEC in patients presenting with diarrhea, especially when due to the non-O157 serotypes. These measures should enhance the overall quality of healthcare and food safety, and provide better protection of the public via improved surveillance and outbreak detection and response.Affiliations

Contexte: La Neisseria gonorrhoeae est devenue résistante à de nombreux antimicrobiens, notamment aux céphalosporines de troisième génération et à l'azithromycine, soit la thérapie combinée pour les infections gonococciques recommandée par les Lignes directrices canadiennes sur les infections transmissibles sexuellement. Objectif: Décrire la sensibilité aux antimicrobiens de la N.gonorrhoeae présente au Canada entre 2012 et 2016. Méthodologie: Les profils de résistance aux antimicrobiens ont été établis au moyen de la méthode de dilution en gélose de la N.gonorrhoeae isolée au Canada de 2012 à 2016 (n=10 167) conformément aux lignes directrices du Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI). Les données ont été analysées en appliquant des définitions de gonocoques multirésistants et de gonocoques ultrarésistants. Résultats: Entre 2012 et 2016, la proportion de gonocoques multirésistants est passée de 6,2% à 8,9% et un total de 19 cas d'infections aux gonocoques ultrarésistants ont été relevés au Canada (0,1%, 19/18768). La proportion d'isolats avec une sensibilité réduite aux céphalosporines a diminué entre 2012 et 2016, passant de 5,9% à 2,0%, tandis que la résistance à l'azithromycine a augmenté, passant de 0,8% à 7,2% au cours de la même période. Conclusion: Même si les cas de gonocoques ultrarésistants sont actuellement rares au Canada, les cas de gonocoques multirésistants ont augmenté au cours des cinq dernières années. La résistance à l'azithromycine de la N.gonorrhoeae est un fait établi et elle se propage au Canada, dépassant le niveau de 5% à partir duquel l'Organisation mondiale de la santé déclare que le traitement par un antimicrobien devrait faire l'objet d'un examen pour vérifier s'il est approprié. La surveillance continue de la sensibilité aux antimicrobiens de la N.gonorrhoeae est nécessaire pour éclairer les lignes directrices en matière de traitement et atténuer l'impact de la gonorrhée résistante.

nom du Réseau des laboratoires de santé publique du Canada (RLSPC). Recommandations du Réseau des laboratoires de santé publique du Canada (RLSPC) pour la détection en laboratoire d'Escherichia coli producteurs de Shiga-toxines (O157 et non-O157) Relevé des maladies transmissibles au Canada 2018;44(11):345-9. https://doi.org/ccdr.v44i11a06f Mots-clés : recommandations pour les analyses de laboratoire, Escherichia coli producteur de Shiga-toxines, STEC O157, STEC non-O157, tests diagnostiques sans culture, tests d'amplification des acides nucléiques (TAAN), dosage immuno-enzymatique, milieu de culture chromogène.

Des articles publiés en Allemagne (5 cas) 2 , en Suisse (6 cas) 1 et au Royaume-Uni (17 cas) 9 montrent que la plupart des patients présentaient une endocardite, un abcès paravalvulaire, une infection au site de l'intervention ou une bactériémie associés à un pontage aortocoronarien, à un remplacement valvulaire ou à une réparation valvulaire. Les signes et symptômes accompagnateurs les plus courants étaient notamment de la fatigue, de la fièvre, une hépatite, une insuffisance rénale, une splénomégalie et une pancyopénie.