Resumo A fermentação anaeróbia de resíduos agroindustriais, apresenta-se como uma alternativa interessante para transformação da matéria orgânica em produtos com valor agregado, como ácidos orgânicos e solventes, tornando o processo atrativo dos pontos de vista ambiental e econômico. Os experimentos foram conduzidos em reatores de batelada mantidos em estufa incubadora rotatória (shaker) a 100 rpm, alimentado com manipueira e reator contínuo de leito fixo preenchido com pellets de polietileno para aderência de biofilme. alimentados com vinhaça. Os reatores foram inoculados com lodo anaeróbio do tratamento de dejetos de bovinocultura tratados termicamente e operados em temperatura de 37ºC. Os resultados obtidos durante a operação de reatores anaeróbios indicaram a estabilidade do sistema reacional e a viabilidade da utilização de resíduos como vinhaça e manipueira como substratos para a produção de ácidos orgânicos por meio do uso de uma cultura mista de microrganismos.