Hewan karang memperoleh energi dengan dua cara yaitu dengan memakan plankton di perairan dan bersimbiosis dengan alga yaitu zooxhantellae. Tingginya nitrat dan fosfat perairan dapat menyebabkan turunnya densitas zooxhantellae. Nitrat dan fosfat di perairan dapat berpengaruh buruk terhadap zooxhantellae. Karena itu, maka penelitian ini bertujuan untuk melihat sejauh mana pengaruh nitrat dan fosfat perairan terhadap densitas zooxhantellae pada karang Acropora loisetteae yang ditransplantasikan di perairan Kabupaten Bone. Penelitian dilakukan selama 3 bulan. Hasil penelitian menunjukkan adanya fluktuasi nilai nitrat, fospat dan zooxhantella tiap pengambilan data. Kadar nitrat cenderung naik tiap waktunya, sedangkan kadar fosfat mengalami kenaikan pada T.2 kemudian turun lagi pada T.3 dan densitas zooxhantellae  mengalami tren menurun. Uji korelasi menunjukkan jika tidak ada korelasi antara kadar nitrat perairan dengan densitas zooxhantella, hal yang sama terjadi pada uji korelasi antara fosfat dan densitas zooxhantellae. Kedua nilai korelasi negatif yang artinya peningkatan nitrat dan fosfat akan berpengaruh terhadap penurunan densitas zooxhantellae.