AGRADECIMIENTOSCuando miro hacia atrás me sorprendo de haber llegado hasta aquí, y me doy cuenta de que no lo habría conseguido sin el apoyo de mucha gente que ha estado ahí para ayudar y a la que tengo mucho que agradecer.En primer lugar querría agradecer a mis directores de tesis la dedicación que me han prestado. Al Dr. Fernando Nuez quiero agradecerle la oportunidad que me brindó de trabajar en el COMAV y de desarrollar esta tesis. Al Dr. Joaquín Cañizares le estoy muy agradecida por haber estado ahí en todo momento, para enseñar y aconsejar, sin su apoyo no habría llegado hasta aquí.Me gustaría agradecer todo el apoyo que he recibido de la gente del departamento de Bioinformática del CIPF, a Ana Conesa y a Stefan Goetz por su ayuda con la anotación del los microarrays, y a Fatima Al-Shahrour por implantar nuestra anotación en el Babelomics. También me gustaría agradecer a Montse Plomer y María García su ayuda el el invernadero, y a Jose Blanca su apoyo con toda la parte bioinformática.Además hay un montón de amigos y compañeros del COMAV que en un momento u otro me han ayudado con dudas varias o simplemente estando ahí para hablar y compartir los momentos más duros. Muchas gracias a Elena, Laura C, Laura A, Montse y Toya con las que he tenido el privilegio de compartir parte del camino. También a todos los que siguen por aquí dando guerra Pascual, Inma, Peio, Cris, Carmelo, Ana P, Nuria, Mariola, Javi, Alicia, Santi, Ana A... Para no dejarme a nadie mil gracias a todos.Muchas gracias a toda mi familia, por aguantar lo peor de los nervios, en especial a mi madre y Oti por todas las fiambreras sin las que no habría sobrevivido. Y por supuesto muchas gracias a Robert por apoyarme en todo momento y creer en mi mas que yo.A mi abuela Amparo RESUMEN El cuajado del fruto es uno de los procesos más importantes del desarrollo vegetal, de él dependen la reproducción y propagación de la planta, cuando se trata de especies silvestres, y la producción en el caso de las especies cultivadas. El estudio de los genes regulados durante este proceso es crucial para comprender mejor los mecanismos implicados y mejorar el cuajado, especialmente en condiciones ambientales adversas. El tomate, Solanum lycopersicum, además de ser uno de los principales cultivos de hortalizas, ha sido ampliamente utilizado en investigación, tanto básica como aplicada. Sin embargo, la mayoría de estudios del desarrollo del fruto en esta especie se han centrado en los procesos que tienen lugar durante la maduración y no han abordado el estudio del cuajado a gran escala. En este sentido, el estudio de materiales con capacidad partenocárpica tiene especial interés, facilita el estudio del cuajado sin interferencia de los procesos relacionados con el desarrollo del embrión y posibilita el estudio de los estadios tempranos del desarrollo del fruto independientemente de la polinización. Además, el empleo de estos materiales en la mejora es especialmente ventajoso puesto que permite obtener frutos incluso en ausencia de polinización y fecundación. En tomat...