Concentrações residuais de antibióticos de uso compartilhado pela terapia médica humana e veterinária são cada vez mais frequentes nos mais variados tipos de matrizes ambientais; no entanto, pouco se sabe sobre o impacto que esses fármacos podem acarretar aos microrganismos do solo. Sendo assim, perturbações relacionadas à exposição da microbiota de um latossolo vermelho-amarelo brasileiro a dois antibacterianos, a amoxicilina (AMOX) e a doxiciclina (DOX), foram investigadas por meio da determinação de atividade (mg CO2) e biomassa (Cmic) microbianas, juntamente com o quociente metabólico (qCO2), em amostras de solo que receberam as seguintes concentrações desses compostos: 0,03, 0,3, 3,0, 30 e 300 mg L-1. Os resultados mostraram diferentes efeitos sobre a microbiota e de forma específica para cada antibiótico. A AMOX mostrou-se mais impactante para os microrganismos do solo, com redução da biomassa e aumento do qCO2, enquanto que a DOX reduziu a atividade microbiana, mas sem efeito na biomassa e qCO2.A B S T R A C TThe residual concentrations of antibiotics used by human and veterinary medical therapy are increasingly common in a wide range of environmental matrices, nevertheless little is known about the impact of these drugs on to the soil microorganisms. Therefore, disturbances related to the exposure of the microbiota of a Brazilian Red-yellow Latosol to two antibacterials, amoxicillin (AMOX) and doxycycline (DOX), were investigated through the determination of the microbial activity (mg CO2) and biomass (Cmic), among with the metabolic quotient (qCO2), using soil samples spiked with: 0,03, 0,3, 3,0, 30 and 300 mg L-1 of each drug. The results showed different effects on the microbiota and in a specific way for each antibiotic. The AMOX showed higher impact impacting for the soil microorganisms, with reduction of the biomass and increase of the qCO2, whereas the DOX reduced the microbial activity, but showed no effect in the biomass and qCO2.Keywords: Antibiotics. Amoxicillin. Doxycycline. Bioindicators. Latosols.