A água é um dos recursos naturais mais importantes no planeta e até bem pouco tempo era considerado como um bem infinito. A realização do monitoramento espaço-sazonal das características físicas, químicas e microbiológicas dos corpos hídricos contribui na avaliação ambiental, pois se trata de atividade estratégica relevante para a conservação e gestão destes ecossistemas. Para avaliar a qualidade das águas do Igarapé Santos, as campanhas amostrais foram realizadas no período chuvoso (abril) e no período de estiagem (agosto), sendo as coletas distribuídas em seis pontos: zona rural (P1, P2), zona de transição/rural-urbano (P3) e zona urbana (P4, P5, P6). Foram coletadas amostras de água de superfície (15-30 cm) e avaliadas as características de qualidade da água (físico-química e microbiológica), através dos parâmetros: cor, temperatura, turbidez, pH, CE, sólidos totais em suspensão, ferro, fósforo total, nitrito, nitrato, amônia, coliformes totais e escherichia coli. Verificou-se que nos períodos sazonais, STS (17630 – 37957 mg/L), ferro (0,80 – 0,98 mg/L), fósforo total (0,31 – 0,82 mg/L), coliformes totais (2300 – 10.000 ufc/mL) e e-coli (1080 – 7250 ufc/mL) estão superiores ao Valor Máximo Permitido (VMP) pela Resolução CONAMA nº 357/05 para o enquadramento de corpos d’água nível classe 2. O grupo de parâmetros de qualidade da água no período chuvoso (p = 0,0000629) e de estiagem (p = 0,0000353) obtiveram-se médias heterogêneas, refletindo a influência da sazonalidade amazônica sob a qualidade das águas deste igarapé. Assim, o prosseguimento aos estudos é de fundamental importância para avaliação contínua da qualidade hídrica da bacia hidrográfica do Igarapé Santos.