Infecções respiratórias são muito prevalentes na população pediátrica. A Organização Mundial da Saúde afirma que infecções respiratórias, são aquelas que ocorrem no trato respiratório, tanto superior como inferior, causando infecções de origem nasal, bronquiolar, pulmonar e são responsáveis por alta taxa de mortalidade na idade infantil. O estado da Bahia - Brasil é o segundo Estado em número de internações por doenças do aparelho respiratório na população pediátrica. O quadro clínico, em sua maioria, é inespecífico dificultando o diagnóstico etiológico. Os quadros geralmente acometem as vias aéreas superiores, mas podem se agravar, migrando para vias aéreas inferiores por infecção viral ou em coinfecção com agentes bacterianos, principalmente por Staphylococcus aureus. Estudos de identificação dos agentes etiológicos são importantes porque auxiliam na assertiva do diagnóstico, direcionam o uso correto do fármaco, favorecendo o uso racional de antibióticos e assim reduzir o grande problema da resistência bacteriana aos antimicrobianos. Trata-se de um estudo transversal, descritivo por amostragem na cidade de Juazeiro, Bahia, através de levantamento amostral de crianças nos serviços de atendimento pediátrico da rede municipal, coletando dados sócio demográficos, epidemiológicos e o histórico do evento, além de amostras da nasofaringe do paciente. A partir da coleta das amostras foram realizados triagem de isolados, através de cultivo microbiológico. A prevalência de Staphylococcus spp., foram isolados. O presente estudo abre uma porta para novas investigações na realidade do município. Outros estudos podem complementar e confrontar os resultados encontrados.