Introdução: A pandemia COVID-19 afetou o setor hospitalar, demandando recursos, insumos, equipamentos e mão de obra qualificada. Objetivo: Comparar os custos com recursos materiais em unidade antes e durante a pandemia da COVID-19. Método: Quantitativo, longitudinal, com análise documental retrospectiva referente segundo semestre de 2019 e de 2020, realizado na unidade de internação médico cirúrgico adulto de um hospital universitário referência para COVID-19. Resultado: A unidade teve médias de 1.634 pacientes/mês (2019) e 1.242 (2020), com diferença significativa (p=0,008). O custo médio diário foi de R$ 1.410,55 /US$ 281,58 (2019) e R$1.711,70 / US$341,70 (2020), sem significância estatística (p=0,190), os custos indiretos representaram mais de 60% do total de custos em 2020. Conclusões: Reflexo na ocupação de leitos e nos custos com recursos materiais, principalmente devido ao aumento do consumo de equipamentos de proteção individual. Os custos indiretos são representativos na conta da unidade e aumentaram durante a pandemia, custos diretos e variáveis com medicamentos, órteses e próteses e materiais médico hospitalares de alto custo tiveram significância estatística.