Espèce d'intérêt économique, le karité a un âge à la première mise à fruit compris entre 12 et 20 ans. Ceci rallonge son schéma de sélection. Pour lever cette contrainte il faut effectuer des tests précoces dès l'âge de la pépinière. La présente étude porte sur cinq ethno-variétés de karité identifiées au Burkina Faso. Les ethno-variétés sont des noms attribués par les paysans à différentes variantes de fruits du karité. L'objectif de l'étude est d'identifier des caractères juvéniles pertinents comme indice de sélection précoce. L'étude porte sur 100 plantules de 5 ethno-variétés. Au total 16 variables biométriques ont été mesurées au niveau des parties aériennes et souterraines. Les analyses statistiques révèlent des différences significatives entre les ethnovariétés au niveau du nombre de rameau (P=0,04), du poids sec des feuilles (P=0,02), de la largeur de la feuille (P=0,03), la longueur du pivot (P=0,0001), du poids frais des racines (P=0,005) et du poids sec des racines (P=0,014). De plus un compromis d'investissement des ressources est observé entre les parties aériennes et souterraines ainsi qu'entre les racines principales et secondaires. Il ressort de cette étude que les caractères discriminants au jeune âge constituent des indicateurs pour une sélection précoce des ethno-variétés.