A pandemia causada pelo novo coronavírus Sars-Cov-2 evidenciou a necessidade de uma educação científica comprometida com o pensamento crítico requerendo dos educadores constantes metamorfoses tanto nas estratégias quanto no uso de recursos didáticos e tecnológicos. Imersos nesse cenário, assumimos o desafio de desenvolver o componente curricular ‘Ensino de Ciências por Investigação’ junto à 23 estudantes do curso de Licenciatura em Ciências Biológicas da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN) ao longo do Período Letivo Suplementar Excepcional (PLSE) 2020.5. As experiências construídas serviram como campo para a construção deste estudo que tem como objetivo tecer reflexões sistemáticas sobre as estratégias e os recursos didático-tecnológicos utilizados ao longo de um componente curricular ministrado em formato remoto, assim como suas potencialidades e limitações para a educação científica e para a popularização das ciências. Metodologicamente este artigo caracteriza-se como um estudo de caso desenvolvido sob o viés teórico da abordagem qualitativa e epistemológico do pensamento complexo.