Bats belong to the second-largest order in a number of species diversity within the Mammalia class, containing 21 families and more than 1300 species. It is estimated that more than 200 viruses from 28 families have been isolated or detected in 37 different bat genera, many of them related to emerging infectious diseases with the potential to cross species barriers and infect other animals. The group of coronaviruses (CoV) is one of these viruses, which includes CoVs that can cause serious diseases in humans and animals, such as severe acute respiratory syndrome (SARS), Middle East respiratory syndrome (MERS), porcine epidemic diarrhea (PED), swine acute diarrheal syndrome (SADS) and coronavirus disease 2019 (COVID-19). Some of the human and animal coronaviruses appear to be originated from bats. With the advent of new generation molecular techniques and increased surveillance of wild animal species, many new coronaviruses have been identified. The coronaviruses belong to the Nidovirales order and Coronaviridae family. The subfamily Coronavirinae is divided into four genera, Alphacoronavirus (alphaCoV), Betacoronavirus (betaCoV), Deltacoronavirus, and Gammacoronavirus. Since the first report of coronavirus in a Miniopterus pusillus bat, the coronavirus occurrence in a bats population of different regions in the world has been studied and, until now, both alphaCoV and betaCoV have been detected. The aim of this study was to perform a literature review regarding the detection of coronavirus (alphaCoV or betaCoV) in different bat species around the world and their immune response against coronavirus. This review reinforces the importance of these animals as hosts, reservoirs, or sources of viruses, including emerging viruses.

Os morcegos são mamíferos de grande diversidade, amplamente distribuídos no mundo. Apesar da importância desses animais na manutenção dos ecossistemas, estes também representam uma preocupação na saúde pública, uma vez que atuam como reservatórios ou hospedeiros de diferentes patógenos, principalmente vírus. A identificação das espécies de morcegos é essencial para melhor compreensão da origem e da epidemiologia de diversas doenças. Além disso, o entendimento sobre a interação vírus/hospedeiro e o papel dos morcegos na disseminação das doenças é essencial para a manutenção da diversidade e consequente conservação desses animais, permitindo assim, o controle racional dos patógenos albergados por estes. Desta forma, é imprescindível realizar a identificação correta das espécies de morcegos recebidas nos laboratórios, a fim de implantar medidas adequadas de vigilância. Neste sentido, este estudo teve como objetivo identificar geneticamente as espécies de morcegos enviados para diagnóstico de raiva no Instituto Pasteur através do sequenciamento genético parcial do gene citocromo C oxidase subunidade I (COI). Para este estudo foram selecionadas 127 amostras de pulmão de morcegos negativos para raiva obtidos em 2015. As amostras foram submetidas a extração de DNA e PCR tendo como alvo o COI e sequenciamento genético. Como resultado, foram identificadas oito espécies: Artibeus lituratus, Cynomops planirostris, Eumops glaucinus, Glossophaga soricina, Lasiurus ega, Molossus molossus, Molossus rufus e Myotis riparius, distribuídas em três famílias (Phyllostomidae, Molossidae e Vespertilionidae) comumente encontradas no Brasil. O sequenciamento parcial do gene COI foi eficaz na identificação das espécies de quirópteros podendo ser uma ferramenta auxiliar na identificação morfológica e facilmente implantada em laboratórios de biologia molecular.