RESUMO -A agitação do sistema reacional é uma das variáveis de maior influência na reação catalítica, auxiliando na dispersão do catalisador no meio reacional, consequentemente aumentando a conversão. Nessa perspectiva, visando desenvolver um estudo comparativo entre dois sistemas de produção de biodiesel, sendo eles: Sistema 1, um reator batelada sem agitação e o sistema 2, um reator com agitação magnética. Utilizando uma temperatura de 200ºC, com 2% de catalisador a base de argila impregnada com MoO3 (VNI), 4 horas de reação e como matéria-prima os óleos de soja e algodão, para ambos os sistemas. Os óleos obtidos foram analisados por cromatografia gasosa para determinação do teor de éster etílico formado e análise da viscosidade cinemática. Quando utilizou-se o sistema estático a conversão encontrada em ambos os óleos correspondeu a aproximadamente 50%, no sistema com agitação a conversão aumenta consideravelmente alcançando valores próximos a 80%. De acordo com Froehner et al. (2007), a utilização do biodiesel, como combustível substituinte ao diesel derivado de petróleo, tem apresentado grande destaque mundial, devido a sua enorme contribuição ao meio ambiente, como a redução qualitativa e quantitativa dos níveis de poluição ambiental, e por se apresentar como fonte estratégica de energia renovável. No cenário brasileiro, o seu uso pode também reduzir a dependência de importação deste combustível. INTRODUÇÃOAlém da grande contribuição ambiental, o biodiesel pode ser produzido a partir de diferentes fontes lipídicas, que de maneira geral, resumem-se em gordura animal e óleos vegetais degomado ou usado, tais como óleo de soja, mamona, babaçu, algodão, entre outros, descritos em trabalhos de Silva (2011).Na produção de biodiesel comercial, o método mais utilizado, faz uso de catalisadores homogêneos alcalinos, como por exemplo, hidróxido de sódio (NaOH) e potássio (KOH), por meio da reação de transesterificação ou esterificação. O uso destes catalisadores nesta reação se deve principalmente à sua elevada eficiência e baixo custo. Entretanto esses catalisadores apresentam algumas desvantagens como à dificuldade na sua reutilização, recuperação da glicerina, risco de contaminação do produto e gasto elevado de água para purificação do biodiesel.