La monoliasis del cacao (Moniliophthora roreri) es la principal limitante parasítica de la producción de cacao (Theobroma cacao) en México. Una alternativa sostenible para el control de la enfermedad es el uso del hongo Trichoderma. El objetivo del presente estudio fue seleccionar aislamientos nativos de Trichoderma con las mejores características antagónicas y fisiológicas in vitro, para el control de M. roreri. Para ello, se caracterizaron 50 aislamientos de Trichoderma, obtenidos del agroecosistema cacao. El crecimiento micelial y la producción de conidios a 25, 30 y 35 °C se consideraron variables fisiológicas. El micoparasitismo, antibiosis y antagonismo potencial fueron las variables antagónicas. Se encontraron diferencias significativas (P = 0.0001) en todas las variables evaluadas. El intervalo de temperatura óptima para el crecimiento micelial y producción de conidios fue de 25 a 30 °C. El micoparasitismo varió de 0 a 100 % y solo los aislamientos de seis especies mostraron esta característica. La antibiosis osciló entre 6.8 y 55.5 %, y el antagonismo potencial varió de 3.4 a 69 %. Trichoderma virens (TTC017) y T. harzianum (TTC090, TTC039, TTC073) mostraron el mejor biocontrol potencial in vitro, por lo que son cepas prometedoras para futuras investigaciones sobre control biológico de la moniliasis del cacao.