A microbiologia é uma ciência que tem como finalidade estudar os seres microscópicos, como bactérias, fungos, protozoários, algas e vírus, estando eles distribuídos por toda parte do planeta. Esse estudo permite ampliar o conhecimento sobre os microrganismos destacando a sua importância para a saúde humana, manutenção do equilíbrio ecológico, além de suas diversas contribuições industriais advertindo sua presença constantemente no cotidiano do ser humano.  A realidade observada nas escolas, hoje, é de um aprendizado deficiente por parte dos alunos, muitas vezes associada à construção de um conhecimento equivocado e ou pela falta do aprendizado sobre a microbiologia. Desta forma é importante o desenvolvimento de metodologias didáticas que possibilite a absorção das informações de forma eficaz. O presente trabalho tem como objetivo contextualizar o ensino de microbiologia na educação básica brasileira, abordando novas possibilidades metodológicas como alternativas para auxiliar os docentes no planejamento das aulas facilitando o processo de ensino-aprendizagem.