Objetivo: Avaliar a influência do estado nutricional na ocorrência de Infecção Respiratória Aguda em crianças menores de dois anos. Métodos: Utilizou-se um estudo descritivo com abordagem quantitativa, os dados foram coletados no Sistema de Informação da Atenção Básica, disponibilizados pelo Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde, referente ao período de Janeiro de 2009 a Dezembro de 2014. Para análise estatística aplicou-se a Correlação de Spearman, ajustando-se os dados ao modelo binomial negativo com nível de significância de 5%. Resultados: A média de casos de IRA aumente 3% a cada novo caso de desnutrição na faixa etária de 0-12 meses e aumente 1,5% a cada caso de desnutrição na faixa etária de 12-23 meses. Esse estudo encontrou correlação positiva entre os casos de infecção respiratória aguda e desnutrição. Conclusão: A melhora no estado nutricional implica em um menor risco de adoecimento, na redução no tempo de internação, a diminuição com custos hospitalares.