The tumor suppressor gene TP53 and its regulator MDM2 are both key players involved in multiple pathways including apoptosis, cellular transcriptional control and cell cycle regulation. Common germline polymorphisms in these genes may affect colorectal cancer (CRC) susceptibility. An arginine-to-proline substitution at codon 72 in the TP53 gene is reported to decrease apoptotic potential, while a thymine-to-guanine polymorphism at nucleotide 309 (named SNP309) of murine double minute 2 MDM2 gene increases its transcription. These two polymorphisms therefore may be of importance in colorectal carcinogenesis. The relation of these polymorphisms to colorectal cancer in the Algerian population was addressed in this study. DNA samples from 121 controls and 116 cases were genotyped for these two polymorphisms by PCR/RFLP then confirmed by sequencing. Unexpectedly no significant association was found between this potential marker TP53 Arg72Pro and CRC (p > 0.05). However, our findings reveal that individuals with the MDM2 SNP309 GG genotype have a low risk of CRC as compared to the TT genotype (OR = 0.49; 95 % CI: 0.24-0.98, p = 0.04), with more significance for females (OR = 0.16; 95 % CI: 0.06-0.41, p < 0.05). Moreover, no significant association was observed between the combined TP53 and MDM2 genotypes and CRC. Contrary to initial expectations that the GG genotype with high MDM2 levels would increase cancer risk, our results demonstrate that the MDM2 SNP309 GG genotype is associated with decreased risk of colorectal cancer. This is suggesting that other mechanisms independent of increased MDM2 levels can influence cancer susceptibility.

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Une mutation des deux allèles du gène Rb durant le développement rétinien norma est responsable de l’apparition du rétinoblastome. La recherche de mutations au niveau du gène Rb reste difficile, car la majorité des altérations sont uniques et dispersées tout au long du gène. Nous rapportons dans notre étude le résultat de l’analyse du gène Rb au niveau constitutionnel et tumoral dans la population algérienne.Notre étude a porté sur un échantillon de 21 patients atteints de rétinoblastome. Le promoteur et les 27 exons avec leurs séquences introniques flanquantes composant le gène Rb ont été amplifiés et analysés par HPLC (chromatographie liquide à haute performance) suivie d’un séquençage. Les variations de bases identifiées au niveau constitutionnel et tumoral sont au nombre de 7 dont 3 mutations non sens, une mutation affectant le site d’épissage, une délétion et 2 polymorphismes. L’analyse du gène Rb a été réalisée chez des enfants atteints de rétinoblastome ne présentant aucun antécédent familial de la maladie. Par cette étude, nous avons pu identifier deux cas sur les 21 étudiés ayant un rétinoblastome pouvant être transmissible.Deux mutations rapportées n’ont jamais été décrites dans la littérature.

Introduction - Le gène TP53 a fait l’objet de très nombreux travaux. Sa nature polymorphe et son rôle central dans la régulation du cycle cellulaire ont mis en évidence son potentiel de gène candidat dans la susceptibilité et la survenue de différents cancers. Bien que plusieurs polymorphismes du gène TP53 aient été étudiés comme facteurs de risque pour différents cancers, le plus largement étudié est le polymorphisme Arg72Pro (rs1042522), à l’origine d’une substitution d’une Arginie (Arg) en Proline (Pro) ou inversement, connu pour ses différentes fonctions biologiques.Notre objectif est d’explorer la participation du polymorphisme (SNP) Arg72Pro du gène TP53, dans l’expressivité du cancer colorectal (CCR) et du carcinome basocellulaire (CBC) dans une population de l’Ouest Algérien.Matériels et Méthodes - Le déséquilibre de transmission allélique de ce SNP a été réalisé sur une population constituée de 116 individus atteints de CCR, 50 sujets atteints de CBC et enfin une population contrôle constituée de 121 individus sains,par la technique de Biologie Moléculaire PCR/RFLP (Polymerase Chain Reaction/Restriction Fragment LengthPolymorphism).Résultats - L’association du marqueur Arg72Pro avec le CBC a montré une augmentation significative de l’allèle Pro chez les cas par rapport aux contrôles (54% vs 46%, OR=8,85 [4,98-16,03], p<10-7). Cet allèle semble conférer un risque important dedévelopper le CBC. Par ailleurs, les résultats n’ont montré aucune différence significative entre les sujets atteints de CCR et les contrôles, ce qui pourrait exclure son implication dans la survenue du CCR dans notre population (p>0.05).Conclusion - Le polymorphisme Arg72Pro du gène TP53 peut être considéré comme marqueur de risque pour le CBC mais pas pour le CCR.

Retinoblastoma is a pediatric retinal tumor initiated by biallelic inactivation of the retinoblastoma gene (RB1). Most of the alteration being unique and randomly distributed throughout the entire coding region. This study aimed firstly to identify mutations that may affect the RB1 gene in constitutional level witch contribute to the understanding of the molecular pathogenesis of this disease and for early detection of subject at risk and asymptomatic carriers. The detection of variations in 30 patient's DNAs was performed by high performance liquid chromatography (HPLC) followed by sequencing. Secondly, we developed a protocol in silico analysis using different software based on analytic methods (Align GVGD, Mutation tasting, SIFT, PolyPhen, I-Mutant and KD4V) and structural (Swiss-Pdb Viewer). This protocol was used to predict the deleterious effects of mutations on protein pRb. The spectrum of mutation included 2 missense mutations, 1 nonsense mutation, 1 deletion, 1 mutation affecting splice site and 2 polymorphisms. Among these mutations, some were identified in germinal level for children with no family history of the disease. Therefore, in silico analysis identified only three causal mutations, the first intronic mutation in the splice donor site caused probably a frame shift, giving rise to a truncated protein. The second missense mutation c.1903 G˃C was predicted to affect splicing processes. The third mutation c.1961T>A located in exon 20 may disrupt protein function and structure.In this study, in silico analysis has shown the effect of mutations on the structure and function of the protein. It is interesting to compare these results with others functional studies in order to evaluate the functionality of the mutations.