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This article describes a genetic algorithm and its implementation that it allows the alignment of multiple sequences of amino acids by means of relocations that simulate the gaps insertion (holes) and actions of recombination to obtain higher scores in the alignment. Such scores are obtained by means of the method of the sum of even, in which there are considered all the possible combinations of amino acids in each column of the alignment and they are qualified being based on the punctuations of the matrix BLO-SUM62. KEY WORDS RESUMENEl presente artículo describe un algoritmo genético y su implementación, que permite el alineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos mediante reacomodaciones que simulan la inserción de gaps (huecos) y acciones de recombinación para obtener puntajes más altos en el alineamiento. Tales puntajes se obtienen mediante el método de la suma de pares, en el cual se consideran todas las posibles combinaciones de aminoáci-dos en cada columna del alineamiento y se califican basándose en las puntuaciones de la matriz BLOSUM62.

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