Feline immunodeficiency virus (FIV) is the Lentivirus responsible for an immunodeficiency-like disease in domestic cats (Felis catus). FIV is divided into five phylogenetic subtypes (A, B, C, D, and E), based on genetic diversity. Knowledge of the geographical distribution of subtypes is relevant for understanding different disease progressions and for vaccine development. In this study, viral sequences of 26 infected cats from Rio de Janeiro, 8 undergoing treatment with zidovudine (AZT) for at least 5 years, were successfully amplified from blood specimens. gag capsid (CA), pol reverse transcriptase (RT), and env gp120 (V3-V4) regions were analyzed to determine subtypes and to evaluate potential mutations related to antiretroviral drug resistance among treated cats. Subtyping based on phylogenetic analysis was performed by the neighbor-joining and maximum likelihood methods. All of the sequences clustered with subtype B in the three regions, exhibiting low genetic variability. Additionally, we found evidence that the same virus is circulating in animals in close contact. The analysis of FIV RT sequences identified two new putative mutations related to drug resistance located in the RT "finger" domain, which has 60% identity to human immunodeficiency virus (HIV) sequence. Amino acid change K3R at codons 64 and 69 was found in 25% and 37.5% of the treated animals, respectively. These signatures were comparable to K65R and K70R thymidine-associated mutations found in the HIV-1 HXB2 counterpart. This finding strongly suggests a position correlation between the mutations found in FIV and the K65R and K70R substitutions from drug-resistant HIV-1 strains.

RESUMO FIV e FeLV são retrovírus associados principalmente com neoplasias. Dois testes rápidos são disponibilizados no Brasil para o diagnóstico dessas infecções: um kit de imunocromatografia de fluxo bidirecional (SNAP® Combo IDEXX) e um kit de imunocromatografia de fluxo lateral unidirecional (ALERE/BIONOTE Anigen Rapid). O objetivo deste estudo foi comparar o teste SNAP® com o teste ALERE. Amostras de sangue de 178 gatos foram testadas utilizando-se ambos os kits. A reação em cadeia de polimerase em tempo real (qPCR) foi empregada como método confirmatório para todos os resultados. O teste SNAP® apresentou sensibilidade e especificidade de 100% para FIV; a sensibilidade e a especificidade do teste ALERE foram de 96,15% e 98,68%, respectivamente. A sensibilidade e a especificidade para o FeLV foram de 93,02% e 96,30% para o teste SNAP® e de 90,70% e 97,78% para o teste ALERE. Ainda em relação ao FeLV, três amostras com resultado positivo na qPCR obtiveram resultado falso-negativo em ambos os testes. Não houve diferença estatisticamente significante entre os métodos. Considerando a qPCR como padrão-ouro, o teste SNAP® apresentou maior sensibilidade e especificidade para o FIV, e o teste ALERE apresentou maior especificidade para o FeLV. Os resultados mostraram uma boa correlação entre os testes.