Objetivo: Este trabalho objetiva analisar o ensino da Economia Ecológica e sua capacidade de formulação de uma pedagogia própria. Como referência teórica se utiliza de trabalhos produzidos por teóricos da educação superior, das ciências sociais e os principais teóricos do campo recente da Economia Ecológica, no intuito de buscar chaves metodológicas, algumas, em uso na experiência da Universidade Federal do Ceará. Métodos: A pesquisa analisou qualitativamente elementos da experiência do único curso de graduação em Economia Ecológica conhecido, a sua intencionalidade pedagógica, expressa no projeto de curso, articulado com o debate sobre as finalidades da universidade. Resultado: A pedagogia própria, ecossistêmica, em uma perspectiva biocêntrica necessita de um percurso histórico que contenha elaboração teórica e prática dos sujeitos envolvidos, a recente proposição de um bacharel em economia ecológica aponta para um horizonte de sociedades sustentáveis, a partir de princípios de justiça ambiental e da perspectiva biocêntrica.