As espécies arbóreas têm potencial para aproveitamento em diversos setores e cadeias produtivas. Neste contexto, a biometria constitui-se em uma importante ferramenta para identificar as principais características intrínsecas ao fruto e a semente. Portanto, objetivou-se com este estudo caracterizar biometricamente os frutos, sementes e plântulas da espécie Cenostigma tocantinum Ducke, de modo a obter informações sobre a variação das características. Para a avaliação da biometria foram utilizados 100 frutos frescos de diferentes árvores matrizes. As características avaliadas foram: comprimento, largura e espessura de fruto e sementes, peso dos frutos, número de sementes por fruto, emergência de plântulas, comprimento da parte aérea, raiz principal e total das plântulas. Constatou-se variabilidade paras os caracteres biométricos relacionados as dimensões e pesos de frutos de Cenostigma tocantinum. O percentual de emergência das plântulas foi de 98%. Os resultados encontrados nesse estudo podem auxiliar na diferenciação e identificação da espécie, fornecendo dados biométricos de importantes características botânicas e da espécie no estágio inicial do crescimento.