Objetivo: avaliar o perfil das potenciais interações medicamentosas da Unidade de Terapia Intensiva Neonatal (UTI-Neo) de um hospital público infantil do interior da Bahia. Métodos: Foi realizado um estudo descritivo, com delineamento transversal. Foram coletadas e analisadas as prescrições médicas (PM) impressas da UTI neonatal no período de 01 de maio de 2016 a 31 de outubro de 2016. Foram incluídas somente PM contendo identificação dos pacientes, data, assinatura e carimbo do prescritor e que possuíam dois ou mais fármacos. Os dados foram analisados no software Micromedex®, classificando as interações medicamentosas potenciais (IMP) segundo gravidade, documentação, mecanismo de ação, manejo da interação e consequência potencial. A análise estatística foi realizada com auxílio do software IBM Statistical Package for the Social Sciences® (SPSS) 20.0 for Windows®. Resultados: Foram analisadas 1476 PM, sendo identificadas 83 IMP. Em 99,4% das PM foram verificadas uma ou mais IMP, sendo que as mais frequentes foram: fentanil + fenobarbital (10,5%); fentanil + midazolam (10,5%); midazolam + fenobarbital (10,4%). As interações contraindicadas foram: domperidona + fluconazol (0,3%); epinefrina + linezolida (0,1%); gluconato de cálcio + ceftriaxona (0,1%); dopamina + linezolida (0,1%). Conclusão: Este estudo evidenciou alta frequência de IMP em PM na UTI-Neo.