La investigación científica está presente en nuestra cotidianidad sin siquiera darnos cuenta. La tecnología, la innovación, la globalización y todo lo que hoy en día se puede ver, es producto de un proceso previo de prueba y error; de recabar evidencias y ponerlas al servicio de los seres humanos, con el objetivo de mejorar su calidad de vida. Las investigaciones científicas en salud son una de las más importantes y necesarias en la sociedad actual. Solo por medio de la evidencia científica, su publicación y divulgación, los tomadores de decisiones podrán adoptar medidas para mejorar la calidad de vida de sus habitantes. Por ello, convencer a un investigador a postular un manuscrito para publicación o a una institución de apostarle a este tipo de iniciativas, se vuelve un reto cada vez más urgente de superar en nuestro país. Desde la Revista Alerta se abre un espacio de divulgación y promoción de esa cultura científica. Es por eso que hoy por hoy nos encontramos en un proceso de actualización y renovación, con el fin de cumplir los estándares internacionales e indizarla en los buscadores más importantes a nivel mundial y comenzar a posicionar a El Salvador en mejores índices bibliométricos de la investigación científica. Hasta el momento, Alerta se encuentra indizada en sitios como Latindex, REDIB, CiteFactor, Lamjol y muy pronto en LILACS. El camino no ha sido fácil, pero el avance es notorio;  mantener y hacer sostenible la indexación es el reto actual. Es precisamente por cumplir con esos requerimientos internacionales que el nuevo número de esta revista ha sufrido un cambio en su estructura y línea gráfica. Así, las secciones actuales en las que investigadores pueden publicar son: Artículo Original, Artículo de Revisión, Comunicaciones Breves, Informes de Casos y Cartas al Editor. Esto obedece a un criterio de LILACS, donde las secciones se organizan según estructura de los manuscritos y no por sus tópicos. Para el Volumen 3, Número 1, Año 2020, Alerta presenta temáticas relacionadas con la infección tuberculosa latente en personal de salud en la América Latina, asociación entre tuberculosis y diabetes mellitus, así como tres informes de casos clínicos en ginecoobstetricia, dermatología y radiología. El interés de los autores por publicar sus investigaciones cada vez se vuelve más recurrente y demandante. Los científicos que postulan sus manuscritos pueden confiar en que esta revista realiza un proceso de revisión por pares doble ciego, empleando un sistema de gestión en línea como el Open Journal Systems (OJS), que garantiza la transparencia del proceso editorial y se adhiere a las normas y códigos de ética internacionales establecidos, como el Comité Internacional de Editores de Revistas Médicas (ICMJE, por sus siglas en inglés), el Comité de Ética en Publicación (COPE, por sus siglas en inglés) y el Consejo de Organizaciones Internacionales de Ciencias Médicas (CIOMS, por sus siglas en inglés), por mencionar algunos. El reto de una cultura de publicación científica es grande, pero la disciplina, tenacidad y compromiso de los investigadores es aún mayor. En el 2020 vamos por más, encaminados a la ciencia, innovación y excelencia en salud pública. Invitamos a toda la comunidad científica a que se sume a éste esfuerzo.

Introducción. En este trabajo se describen las primeras secuencias completas del genoma de SARS-CoV-2 detectados a partir de muestras de pacientes salvadoreños. Objetivo. Reportar las primeras seis secuencias completas del genoma del SARS-CoV-2 de seis casos autóctonos de COVID-19 detectados en El Salvador, a partir de muestras de secreción nasofaríngea. Metodología. Se realizó una secuenciación de próxima generación NGS a partir de muestras autóctonas en la plataforma Illumina. Resultados. El análisis filogenético mostró que estos aislados pertenecen al clado 20C clado secundario de 20A que tiene en común la variante S:D614G, la mutación D614G de la glicoproteína espícula fue demostrada en las seis secuencias del genoma de SARS-CoV-2. En la plataforma GISAID las secuencias mostraron pertenecer al clado GH linaje pangolín B.1.2 y B.1.370, ambos linajes están presentes en Estados Unidos. Conclusión. Este es el primer reporte de secuencias completas del genoma de SARS-CoV-2 en El Salvador e identifica una variante predominante en Centro y Norte América.

En la actualidad, América Latina y el mundo atraviesa una situación de salud pública que no tiene precedentes en un contexto de globalización como el nuestro1, por lo que estar informados es más importante que nunca, para poder seguir las recomendaciones basadas en la evidencia que contribuyan a proteger la salud2; no solo en lo relacionado a la pandemia de COVID-19, sino en las demás morbilidades que representan una importante carga de enfermedad y causa de mortalidad para los sistemas de salud. La pandemia de COVID-19 ha puesto en evidencia una verdad penosa sobre la ciencia, y es que el actual sistema de comunicación académica no satisface completamente las necesidades de la ciencia y de la sociedad en general;  específicamente, esta crisis pone de manifiesto un  sistema de investigación con  valores predeterminados de una ciencia cerrada con énfasis excesivo en las publicaciones de élite, en idioma inglés3, independientemente del contexto, las consecuencias de la investigación y el conocimiento que ésta genere.  La revista Alerta, tiene el compromiso de contribuir no solo a enfrentar la pandemia, sino a superarla y continuar atendiendo los demás temas prioritarios de la salud, en lo relacionado con la difusión de la producción del conocimiento y la evidencia científica, que contribuya a la toma de las mejores decisiones según nuestro contexto, promoviendo la preservación de nuestro idioma. En el actual volumen, es importante destacar que la publicación científica es un complejo trabajo en equipo interdisciplinario, en el que participan autores, revisores, correctores, diagramadores y editores, quienes han desarrollado su trabajo en la pandemia tratando de garantizar una revisión objetiva, ética y libre de sesgos4; manteniendo los criterios de calidad e indexación, esto puede influir en los tiempos del proceso editorial. Sin embargo, todos los productos de esta publicación cobran especial importancia, ya que tenemos la buena noticia de que Alerta ha sido indexada en Amelica5. En este volumen se presentan artículos originales relacionados con las enfermedades crónicas no transmisibles, sobre los conocimientos actitudes y prácticas de la enfermedad renal  en paciente diabéticos e hipertensos, un informe de caso sobre complicaciones obstétricas causales importantes de mortalidad materna, así como artículos de revisión narrativa y comunicaciones breves relacionadas con la COVID-19 en los temas de transmisión vertical y cuidados del recién nacido y la primera secuenciación genómica de El Salvador con muestras nativas de pacientes en quienes se detectó SARS-CoV-2 que cobra especial importancia para el sistema nacional de salud y para la comunidad científica en general. Así mismo, la comunicación breve de la tasa de infecciones asociadas a la atención sanitaria en neonatos es muy importante en el momento que vivimos, pues aporta buenas prácticas que pueden contribuir a disminuir las tasas de morbimortalidad neonatal. La revista Alerta pretenden que en todas sus publicaciones se garantice el cumplimiento de la ética6, las buenas prácticas de publicación7 y el acceso abierto, para que la información se comparta de manera amplia, rápida y efectiva propiciando con ello que la investigación esté disponible de inmediato, e incentivando la comunicación científica y a todos los interesados, en este caso, los profesionales y técnicos del  sistema nacional de salud, a utilizar este medio de publicación para colaborar, adquirir, compartir y divulgar conocimiento,  contribuyendo así a generar un sistema científico robusto y una ciudadanía informada en el devenir del tiempo.

Se realizó durante el mes de octubre del 2020 la secuenciación del genoma de muestras autóctonas de SARS-CoV-2. Objetivo. Analizar in silico las mutaciones D614G en las secuencias aisladas en El Salvador. Metodología. Se analizaron secuencias utilizando la plataforma bioinformática SOPHiA-DDM-V5.7.10 para la determinación de las variantes por mutaciones con sentido erróneo.  utilizando la plataforma Nexclade beta v0.8.1. se visualizó y comparo la proteína S silvestre (D614: PDB ID: 6VXX) y de la variante mutada (D614G: PDB ID:  6XS6). El modelamiento y generación de imágenes de los detalles moleculares de las proteínas se utilizó Pymol-v1.7.2.3.   Resultados. El análisis de los cristales de la proteína S silvestre y mutada muestra diferencias a nivel molecular incluyendo la pérdida de interacciones entre el residuo G614 del dominio S1 y la treonina 859 de dominio S2, favoreciendo de esta manera la conformación abierta de la proteína S, la cual es necesaria para la interacción de S con el receptor ACE2.Conclusión. El predominio mundial de la D614G y las evidencias de laboratorio y bioinformáticas publicadas hasta la fecha, apuntan hacia una posible mayor infectividad y transmisibilidad conferida por la variante D614G detectada en las secuencias del SARS-CoV-2 en El Salvador.

Introducción. En El Salvador a la fecha, la técnica utilizada por el sistema nacional de salud para la obtención de la muestra para realizar PCR para SARS-CoV-2 es hisopado nasofaríngeo, diferentes investigadores han descrito la muestra de saliva como una muestra biológica útil para la detección de SARS-Cov-2, por esta razón se observa la oportunidad de aplicarla como una alternativa disponible para el diagnóstico de esta enfermedad. Objetivo. Evaluar la autotoma de muestra de saliva y secreción nasofaríngea por pacientes no hospitalizados como una alternativa de menor riesgo biológico y de menor costo que los hisopados nasofaríngeos convencionales. Metodología. Se procesaron las muestras de una mezcla de saliva y secreción faríngea obtenida por carraspeo autotomada por el paciente; la amplificación se realizó por RT-qPCR de los genes E y RdRp. Las muestras positivas se reevaluaron desde su extracción para confirmar la estabilidad de material genético de SARS-CoV-2 en la saliva y secreción nasofaríngea. Resultados. El promedio de resultados positivos por cada 100 pruebas fue de 7,05 por cada 100 pruebas COVID-19 realizadas con hisopado, este resultado es similar al 8 % de positividad durante el mismo período de estudio utilizando como muestra saliva y secreción faríngea autotomada por el paciente. Las ocho muestras positivas mantuvieron su reactividad para los genes E y RdRp al primer, tercer y quinto mes posdiagnóstico inicial para los dos protocolos utilizados. De igual forma, los eluidos de ARN positivos iniciales se mantuvieron positivos al primer, tercer y quinto mes. Conclusión. La muestra de saliva y secreción faríngea y su utilización para el diagnóstico de infección por SARS-CoV-2 podría ser una alternativa de bajo costo, no invasiva, al menos de igual utilidad que el hisopado nasofaríngeo para el estudio de población sintomática ambulatoria o con exposición a nivel comunitario.