Οι νευροεκφυλιστικές παθήσεις είναι χρόνιες, σταδιακά επιδεινούμενες διαταραχές που προσβάλλουν κυρίως το Κεντρικό Νευρικό Σύστημα. Αποτελούν ένα σοβαρό πρόβλημα υγείας παγκοσμίως, ενώ η πλειονότητα των διαθέσιμων θεραπευτικών προσεγγίσεων είναι συμπτωματικές ή παρηγορητικές. Το σύνδρομο της Επιληψίας του Έσω Κροταφιαίου Λοβού (ΕΕΚΛ) είναι μια δυσίατη νευροεκφυλιστική πάθηση που χαρακτηρίζεται από αυθόρμητες επαναλαμβανόμενες εστιακές κρίσεις στις έσω κροταφικές δομές του μεταιχμιακού συστήματος του εγκεφάλου, και συνδέεται συχνά με σκλήρυνση του ιπποκάμπου (ΣΙ). Η κλινική αντιμετώπιση της ΕΕΚΛ αποτελεί μια πρόκληση, καθώς εμφανίζει ανθεκτικότητα στη φαρμακευτική αγωγή και είναι ο τύπος επιληψίας που παραπέμπεται συχνότερα για χειρουργική αντιμετώπιση. Ο σκοπός της παρούσας μελέτης ήταν ο χαρακτηρισμός των μοριακών μηχανισμών που εμπλέκονται στην παθογένεση και την εξέλιξη της ΕΕΚΛ, ώστε να εντοπιστούν νέοι υποψήφιοι θεραπευτικοί στόχοι, με προσεγγίσεις γονιδιωματικής. Για το σκοπό αυτό, πραγματοποιήθηκε ανάλυση της έκφρασης ολόκληρου του γονιδιώματος με μικροσυστοιχίες σε ένα πειραματικό μοντέλο που προκύπτει με μικροέγχυση καϊνικού οξέος (ΚΑ) στον ιππόκαμπο και προσομοιάζει στο ανθρώπινο σύνδρομο, σε τρία χρονικά σημεία που αντιστοιχούν σε διακριτά στάδια της ΕΕΚΛ. Ακολούθησε εντατική βιοπληροφορική ανάλυση και εξόρυξη δεδομένων, για το χαρακτηρισμό των μοριακών αλλαγών που ενδέχεται να σχετίζονται με την παθογένεση και την εξέλιξη της ΕΚΚΛ, και τον εντοπισμό κεντρικών ρυθμιστικών μορίων που μπορεί να ελέγχουν τις παρατηρούμενες αλλαγές και μπορούν να αποτελέσουν υποψήφιους θεραπευτικούς στόχους για την ΕΕΚΛ. Η ανάλυση οδήγησε στην ανακάλυψη πολυάριθμων σημαντικά αλλαγμένων γονιδίων και μοριακών μονοπατιών σε κάθε στάδιο του συνδρόμου που μελετήθηκε, ένω προέκυψαν ευρήματα που έχρηζαν περαιτέρω διερεύνησης, και πραγματοποιήθηκαν επιπρόσθετα πειράματα για τη διερεύνηση του ρόλου του συμπλόκου της οξειδάσης NADPH στην παθογένεση της ΕΚΚΛ. Επιπροσθέτως, πραγματοποιήθηκε ανάλυση της έκφρασης ολόκληρου του γονιδιώματος σε δείγματα ιππόκαμπου ασθενών με ΕΕΚΛ-ΣΙ, για το χαρακτηρισμό των μοριακών μηχανισμών που σχετίζονται με αυτό το ιστοπαθολογικό εύρημα της ΕΕΚΛ. Η παρούσα μελέτη αποτελεί μια λεπτομερή ανάλυση του προφίλ έκφρασης του ιππόκαμπου κατά τη διάρκεια της παθογένεσης και εξέλιξης του συνδρόμου της ΕΕΚΛ, και εξετάζει νέους υποψήφιους θεραπευτικούς στόχους για την πάθηση αυτή.