Το αντικείμενο της παρούσας διδακτορικής διατριβής ήταν η σύνθεση πεπτιδίων με πολλαπλούς δισουλφιδικούς δεσμούς και για το σκοπό επιλέχθηκαν δύο πεπτίδια που το καθένα περιέχει τρεις δισουλφιδικούς δεσμούς. Συγκεκριμένα συντέθηκε η ω-MVIIA κωνοτοξίνη, ένα πεπτίδιο ανοιχτής πεπτιδικής αλυσίδας που αποτελεί τη δραστική ουσία ενός εγκεκριμένου φαρμάκου κατά του χρόνιου πόνου και το CyO2 κυκλοτίδιο το οποίο είναι ένα κυκλικό πεπτίδιο με πολύ σταθερό μοτίβο CCK που το καθιστά ανθεκτικό τόσο σε ενζυμική όσο και σε χημική κατεργασία. Η σύνθεση της γραμμικής αλληλουχίας των πεπτιδίων πραγματοποιήθηκε εφαρμόζοντας αντιδράσεις κλασικής οργανικής χημείας χρησιμοποιώντας τη μέθοδο της σταδιακής προσθήκης αμινοξέων καθώς και τη συμπύκνωση πεπτιδικών τμημάτων. Πρωταρχικό στόχο αποτέλεσε η επιτυχής σύνθεση της πεπτιδικής αλληλουχίας σε υψηλή καθαρότητα και δεύτερος ο εκλεκτικός σχηματισμός των δισουλφιδικών δεσμών. Οι προστατευτικές ομάδες των κυστεϊνών καθώς και η θέση αυτών στην πεπτιδική αλληλουχία απεδείχθησαν καθοριστικής σημασίας για τον εκλεκτικό σχηματισμό των δισουλφιδικών δεσμών. Στην περίπτωση της κωνοτοξίνης, η εξακρίβωση του σωστού ισομερούς πραγματοποιήθηκε με συνδυασμό χημικής και ενζυμικής κατεργασίας ενώ αυτή η προσέγγιση δεν ενδείκνυται στην περίπτωση του κυκλοτιδίου διότι το CCK μοτίβο καθιστά αδύνατη την παραγωγή μοναδικών θραυσμάτων και συνεπώς απαιτείται συνέκλουση με το φυσικό προϊόν.