Неинвазивное пренатальное тестирование (НИПТ, Non-Invasive Prenatal Testing, NIPT) с целью выявления трисомий в последнее время получило широкое распространение в клинической практике во многих странах, включая Россию. Несмотря на то, что НИПТ не позволяет оценить количество и структуру всех хромосом плода (это возможно только путём кариотипирования), этот анализ обладает хорошими показателями чувствительности и специфичности, а также позволяет устранить риски, сопровождающие инвазивные диагностические процедуры (амниоцентез, кордоцентез, биопсия ворсин хориона и т.д.). Для НИПТ преимущественно используют последовательности внеклеточной фетальной ДНК (cell-free fetal DNA, cffDNA), которые в небольшой концентрации присутствуют в крови беременной женщины и исчезают после беременности. В настоящее время для НИПТ используют методы высокопроизводительного секвенирования (Next Generation Sequencing, NGS). В обзоре приведены основные подходы и методы, применяемые для НИПТ с целью обнаружения трисомий: массовое параллельное секвенирование методом дробовика (massive parallel shotgun sequencing, MPSS), таргетное массовое параллельное секвенирование (targeted massive parallel sequencing, t-MPS) и подходы, основанные на изучении однонуклеотидных полиморфизмов (single nucleotide polymorphism, SNP), а также произведено сравнение эффективности их использования для выявления трисомий по хромосомам 13, 18 и 21 (синдромов Патау, Эдвардса и Дауна, соответственно). При использовании MPSS анализу подвергаются последовательности всего генома, а при t-MPS - только специфические последовательности. В статье обсуждаются также методы анализа мРНК, эпигенетических маркёров плода и дополнительные методы усиления сигнала (например, DANSR, Digital Analysis of Selected Regions, цифровой анализ выбранных областей). В обзоре приведены основные причины появления ложных (ложноположительных и ложноотрицательных) результатов при НИПТ (мозаицизм, феномен “резорбция двойни”, низкий уровень cffDNA и др.). Дано краткое описание современного места НИПТ в клинической практике и перспектив включения НИПТ в схему пренатального скрининга, а также основных трудностей, ограничивающих более широкое применение технологии НИПТ в клинике. Прежде всего эти трудности связаны со спецификой cffDNA (концентрация, индивидуальные отличия и др.), а также с этическими аспектами (генетический детерминизм, информированное согласие пациентов и др.). Non-invasive prenatal testing (NIPT) of trisomy has recently become widespread in clinical practice in many countries, including Russia. Despite the fact that NIPT does not allow to estimate the number and structure of all chromosomes of the fetus (this is possible only when using karyotyping), this analysis has good sensitivity and specificity indicators, and also allows eliminating the risks accompanying invasive diagnostic procedures (amniocentesis, cordocentesis, chorionic villus biopsy, etc.). The sequences of cell-free fetal DNA (cffDNA), which are present in low concentrations in the blood of a pregnant woman and disappear after pregnancy, are mainly used for NIPT. Currently NIPT uses Next Generation Sequencing methods (NGS). The review presents main approaches and methods used for non-invasive prenatal testing of trisomy: massive parallel sequencing by the shotgun method (MPSS), targeted parallel sequencing (t-MPS) and approaches based on the study of single nucleotide polymorphisms (SNP). In review we also compare efficacy of their use for the detection of trisomy of chromosomes 13, 18 and 21 (Patau syndrome, Edwards syndrome and Down syndrome, respectively). When using MPSS, sequences of the whole genome are analyzed, and with t-MPS, only specific sequences of interest are analyzed. The article also discusses methods for analyzing mRNA, fetal epigenetic markers, and additional signal amplification methods (for example, DANSR, Digital Analysis of Selected Regions). The review presents the main reasons for the appearance of false (false positive and false negative) results in NIPT (mosaicism, the phenomenon of “twin resorption”, low levels of fetal DNA, etc.). A brief description of the current place of NIPT in clinical practice and prospects for the inclusion of NIPT in the prenatal screening scheme, as well as the main difficulties that limit the wider use of NIPT technology in the clinic, are given. Primarily, these difficulties are associated with the specificity of cell-free fetal DNA (concentration, individual differences, etc.), as well as ethical issues (genetic determinism, informed patient consent, etc.).
В последние годы интенсивно разрабатываются неинвазивные методы дородовой диагностики различной наследственной патологии. Риск развития акушерских осложнений при их проведении существенно ниже, чем при использовании инвазивных методов. Наиболее часто неинвазивные методы, не требующие забора плодного материала, применяют для диагностики у плода врожденных пороков развития и хромосомных синдромов. Сфера неинвазивной пренатальной диагностики не ограничивается диагностикой генетических особенностей и анеуплоидий плода. Одно из активно развивающихся направле-ний -неинвазивное генетическое определение резусфактора плода у резус-отрицательной беременной женщины [1][2][3][4].До настоящего времени преемственность результатов исследований -речь идет о неинвазивной пренатальной диагностике (НИПД) -от научных изысканий до клинической практики была довольно фрагментирована. Успехи в улучшении аналитических характеристик тестсистем, стандартизация протоколов выделения внеклеточной фетальной ДНК (вкфДНК) и последующей амплификации с использованием полимеразной цепной ре-Представлен клинический опыт неинвазивной пренатальной диагностики резус-фактора плода по исследованию крови беременной. Цель исследования -определение аналитических возможностей методики неинвазивного определения резус-фактора плода по исследованию крови беременной с использованием наборов реагентов Тест-RHD плюс, Ампли-Прайм ДНК-сорб-Б, Rotor-Gene6000. Материал и методы. В исследование включены результаты обследования 46 беременных резус-отрицательных женщин, родоразрешенных в БУЗОО «Городской клинический перинатальный центр». Проводилась диагностика Rh-принадлежности плода с помощью экстракции внеклеточной циркулирующей фетальной ДНК из крови беременной и проведения полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флюоресцентной детекцией с применением набора реагентов. На основе полученных данных рассчитаны аналитические возможности методики. Результаты. Диагностическая точность метода составила 97,82%, чувствительность -100%, специфичность -92,85%, прогностическая ценность положительного результата -96,96%, прогностическая ценность отрицательного результата -100%. Заключение. При четком соблюдении условий проведения исследования методика неинвазивного определения резусфактора плода по крови беременной женщины с использованием набора реагентов Тест-RHD плюс может быть рекомендована к применению в повседневной лабораторной практике.Авторы информируют об отсутствии конфликта интересов.Ключевые слова: беременные, неинвазивная пренатальная диагностика, резус-фактор плода, внеклеточная фетальная ДНК.The paper presents the clinical experience with noninvasive prenatal diagnosis of fetal rhesus (Rh) factor by a pregnant woman's blood testing. Objective: to define the analytical capabilities of a procedure for the noninvasive determination of fetal Rh factor by a pregnant woman's blood testing using the reagent kits Test-RHD plus, AmpliPrime DNA-sorb-B, and Rotor-Gene6000. Subjects and methods. The investigation included the results of examinations in 46 Rh-negative pr...
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
customersupport@researchsolutions.com
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
This site is protected by reCAPTCHA and the Google Privacy Policy and Terms of Service apply.
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.