Аннотация. Разработан программный комплекс, предназначенный для анализа структуры поверхностей белков с целью выявления функциональных сайтов связывания белков. Комплекс позволяет осуществлять построение поверхностей белков, поиск структурных особенностей построенных поверхностей (карманов, каналов и полостей) и исследование найденных структурных особенностей. С помощью разработанного комплекса определен один из функциональных сайтов гранулоцитарного колониестимулирующего фактора человека и спрогнозирован его низкомолекулярный пептидный функциональный аналог. Ключевые слова: функциональный сайт белка, поверхность белка, структурные особенности поверхности белка, карманы, каналы, полости. ВВЕДЕНИЕПоиск потенциальных сайтов связывания белков -актуальнейшая задача биохимии, решение которой лежит в ее новой, быстро развивающейся области -биоинформатике. Успешное предсказание участков связывания белков с их лигандами является предпосылкой для решения ряда других не менее актуальных задач биохимии, к которым можно отнести прогноз белок-белковых и белок-ДНК взаимодействий, выявление функциональных сайтов белков с известными функциями и предсказание функциональных свойств новых белков, структуры которых получены, в частности, в ходе выполнения геномных проектов. Каждая из перечисленных задач лежит в основе решения разнообразных прикладных и практически значимых подзадач, связанных, в первую очередь, с целенаправленным конструированием соединений с заданной биологической активностью. Такой рациональный подход к созданию соединений с заданными свойствами позволяет существенно снизить как временные, так и материальные затраты на создание, в частности, новых лекарственных препаратов.Так как функциональные свойства белков определяются их конформацией, то есть расположением полипептидной цепи в пространстве [1], то поиск сайтов связывания белков логично основывать на анализе и исследовании их пространственной структуры. Развитие физико-химических методов, позволяющих экспериментально определять пространственную организацию макромолекул, привело к появлению банков и баз с биохимическими данными и размещению в них расшифрованных пространственных структур как белков, так и их комплексов с лигандами различной природы. Накопление большого объема этих биохимических данных дало импульс к * shutova2001@mail.ru