A new taxon of the subfamily Chordopoxvirinae that may represent a new genus of smallpox viruses is considered in this review. The distribution of gray squirrels (Sciurus carolinensis) throughout the UK during the 20th century and the decrease in the population of red squirrels (Sciurus vulgaris) is one of the most well-documented cases of ecological change of local fauna by the introduced species. The tendency to expand the distribution of the smallpox virus from Great Britain to the Western part of Europe has been noted. The genetic peculiarities of the genome of the poxvirus of squirrels, which determine its biological properties, as well as evolutionary relationships with other poxviruses, are separately described. Determination of the size of the genome by restriction analysis, sequencing of the whole genome, determination of the content of G/C nucleotide pairs, and functional mapping of the majority of genes made it possible to construct a phylogenetic tree. Phylogenetic analysis shows that this is a new representative of the subfamily Chordоpoxvirinae located between the viruses of the molluscum contagiosum and parapoxviruses. Serological and molecular biological methods are used to reveal and identify the causative agent of smallpox. The use of electron microscopy is limited in grey squirrels, due to the absence of organ damage and reproduction of the virus. Identification of the DNA of the causative agent of poxvirus of squirrels based on the use of different types of polymerase chain reaction (nested and in real time) overcomes all these limitations.

Ближневосточный респираторный синдром представляет опасное заболевание человека, вызываемое новым коронавирусом. В декабре 2012 г. ВОЗ опубликовала временные руководящие документы по диагностике этого вируса. ВОЗ рекомендует использовать два способа диагностики этого заболевания-двухэтапную обратно-транскриптазную ПЦР в реальном времени (ОТ-ПЦР-РВ) и иммуноферментный анализ. Первый этап ПЦР-диагностики должен включать ОТ-ПЦР-РВ с мишенью на фрагмент генома выше upE гена. Второй (подтверждающий) ПЦР-тест может быть направлен на альтернативные мишени в пределах вирусного генома, не перекрывающиеся с upE геном, и последующее секвенирование, по крайней мере, сегмента одного из вирусных генов и сравнение полученной последовательности с таковыми, депонированными в GenBank. Метод ИФА применяется ретроспективно с целью определения наличия вирусоспецифических антител в сыворотках крови реконвалесцентов. В статье рассмотрены основные характеристики данных методов выявления возбудителя заболевания или специфических антител к нему, и методические рекомендации ВОЗ при диагностике Ближневосточного респираторного синдрома. Ключевые слова: коронавирус, Ближневосточный респираторный синдром, респираторные инфекции, обратная транскрипция, полимеразная цепная реакция, иммуноферментный анализ, секвенирование генома, филогенетический анализ.

The review presents the results of preclinical use of vector vaccines against human immunodeficiency virus (HIV) disease and simian immunodeficiency virus (SIV) disease. Application of antiretroviral therapy exclusively is insufficient for elimination of HIV from patient’s body. This dictates the need for an effective vaccine which will reduce the number of new cases of the disease and reduce the risk of virus transmission. Current practice of medicinal product development showed the effectiveness of heterologous prime-boost regimens for the induction of expressed immune response in laboratory animals. Various vector constructs were used as priming vaccines: DNA vaccines, Bacille Calmette-Guerin vaccine, chimpanzee adenovirus, vesicular stomatitis virus, alphavirus repli-clone. Booster vaccine was represented by recombinant MVA strain. In all vector vaccines, different genes of immunodominant antigens of HIV and SIV agents were inserted. On rhesus macaques, murine, rabbit models, it was demonstrated that deployed vaccination schemes were safe and induced immune response. Because membrane HIV protein is highly variable, strongly glycoziled and subjected to structural changes during receptor binding, it cannot be viewed as a target for induction of virus neutralized antibodies. Therefore, we mainly studied the cell immune response that was presented by poly-functional CD8+ T-cells. However, some recent researches are aimed at such modification of envelope HIV immunogene that would provide for virus neutralizing antibody induction. The study of protective efficiency of the induced immunity in rhesus macaques, immunized with recombinant vectors expressing SIV’ s immunodominant antigens, in case of subsequent inoculation with virulent SIV strain has revealed that all monkeys developed illness. Assuming that the constructions with SIV’ s immunodominant antigens under protective efficiency testing on rhesus macaques imitate AIDS in humans, it seems that vaccines, developed up-to-date, will not be effective for collective immunity formation against AIDS. Therefore, the search for novel combinations of expressed immunodominant antigens for the inclusion into the composition of priming and booster vaccines remains a priority area at present time.

молекулярно-генетические особенности строения генома представителей рода Ebolavirus ФГБУ «48 Центральный научно-исследовательский институт» Министерства обороны, Сергиев Посад, Российская Федерация Рассмотрены молекулярно-генетические особенности структуры генома представителей рода Ebolavirus. Отмечено, что эпидемические вспышки лихорадки Эбола в Африке представляют потенциальную угрозу для здравоохранения не только стран этого континента, но и всего мира, вследствие возможности завоза возбудителя в неэндемичные регионы. Представители рода Ebolavirus обладают различной патогенностью для человека, что определяет различия показателей смертности и тяжести болезни. Между представителями рода Ebolavirus имеется значительная генетическая дивергенция. Изменение патогенного потенциала представителей рода Ebolavirus может быть объяснено мутациями в генах структурных белков вируса. Вероятно, некоторые мутации в этих генах могут оказывать влияние на вирулентность штаммов в пределах одного вида вируса. Поскольку наиболее эффективные имеющиеся на сегодняшний день средства экстренной профилактики и лечения имеют строго дифференцированную направленность, генотипирование представляет большое значение при разработке стратегии создания таких препаратов.

No abstract