In total 1,525 blood serum samples were collected in October, 2013 in Russian Asia from people who reside in territories that are at high risk for emergence of influenza viruses with pandemic potential. Presence of antibodies to influenza viruses in the sera was tested in hemagglutination inhibition test. None of the samples produced positive results with the antigens A/H5 and A/H7. Twelve strains of influenza A(H1N1pdm09) virus were isolated from people who died presumably from influenza during 2013-2014 epidemic season. All strains were similar to vaccine strain A/California/07/09 according to their antigenic properties and sensitivity to anti-neuraminidase drugs (oseltamivir and zanamivir). Genetic analysis revealed that all strains belong to group 6, subgroup 6B of influenza A(H1N1)pdm09 virus. Substitutions in HA1: S164F add E235K as well as E47G, A86V, K331R, N386K, N397K in NA, and K131E, N29S in NS1, and N29S, R34Q in NEP separate investigated strains into two groups: 1st group-A/Chita/1114/2014, A/Chita/1115/2014, A/Chita/853/2014, A/Barnaul/269/2014 and 2nd group-A/Chita/655/2014, A/Chita/656/2014, A/Chita/709/2014, A/Chita/873/2014. Mutation D222G in HA1, which is often associated with high morbidity of the illness, was present in strain A/Novosibirsk/114/2014. Substitution N386K in NA removes a potential N-glycosylation site in neuraminidases of A/Chita/1114/2014, A/Chita/1115/2014, A/Chita/853/2014, A/Barnaul/269/2014, A/Novosibirsk/114/2014, and A/Blagoveshensk/252/2014.
Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, р.п. Кольцово, Новосибирская область, 630559, Российская Федерация State Research Center of Virology and Biotechnology VECTOR, Koltsovo, Novosibirsk Oblast 630559, Russian Federation Многие острые вирусные инфекции вызывают сходную клиническую симптоматику, поэтому установление этиологии вирусного заболевания требует применения целых комплексов серологических или ПЦРтестов, предназначенных для выявления отдельного вида патогена. Современные методы молекулярной биологии позволяют проводить раннюю диагностику вирусных заболеваний в тот период, пока серологические методы диагностики еще не эффективны. Цель работы состояла в проведении анализа методов молекулярной диагностики, позволяющих определять вирусные нуклеиновые кислоты в крови человека. В статье представлена классификация молекулярных методов диагностики вирусных частиц в клинических образцах. Подробно рассмотрены такие методы, как гибридизация in situ, реакция обратной транскрипции (ОТ-ПЦР), двухраундовая ПЦР, мультиплексная ПЦР, а также технология ДНК-микрочипов, метод массового параллельного секвенирования. Особое внимание уделено NGS-технологиям, которые стали использоваться в вирусологии практически сразу же после их появления и позволили обнаружить целый ряд новых видов вирусов человека (включая представителей анелловирусов, пикорнавирусов, полиомавирусов и др.). Обсуждаются достоинства, проблемы, связанные с применением этих методов в клинической практике, а также перспективы их усовершенствования. Ключевые слова: амплификация; вирусные инфекции; массовое параллельное секвенирование; молекулярная диагностика; полимеразная цепная реакция Для цитирования: Абдурашитов МА, Нетесова НА. Определение вирусных нуклеиновых кислот в крови человека. БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение. 2018;18(4):208-215. https://doi.* Контактное лицо: Нетесова Нина Александровна; ninanet@vector.nsc.ruMany acute viral infections cause similar clinical symptoms, therefore, establishing the etiology of a viral disease requires the use of whole complexes of serological or PCR tests designed to detect a particular type of pathogen. Modern methods of molecular biology allow early diagnosis of viral diseases at a time when serological diagnostic methods are not yet effective. The aim of the work was to analyze molecular diagnostic methods that allow the determination of viral nucleic acids in human blood. The article presents the classification of molecular methods for the diagnosis of viral particles in clinical specimens. Methods such as in situ hybridization, reverse transcription reaction (RT-PCR), nested PCR, multiplex PCR, as well as DNA microarray technology, and the method of massive parallel sequencing are considered in detail. Particular attention is paid to NGS-technologies that were used in virology almost immediately after their appearance and allowed for detec...
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
customersupport@researchsolutions.com
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
This site is protected by reCAPTCHA and the Google Privacy Policy and Terms of Service apply.
Copyright © 2025 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.