На основе данных ИК спектромикроскопии с использованием синхротронного излучения проведено исследование вторичной структуры белков дентинной и десневой жидкостей человека при развитии кариозного процесса в глубоких тканях дентина. Показано, что изменение формы профиля полосы Амид I в области 1700-1605 cm-1 связано как с изменением соотношения интегральных интенсивностей вторичных структур alpha-cпираль и beta-лист, так и положением компонент beta-витки и beta-лист в спектре. Установлено, что величина соотношения alpha-спираль/beta-лист как для дентинной, так и десневой жидкостей лежит ниже порогового уровня, при котором наблюдаются значительные изменения во вторичной структуре белков биологических жидкостей и однозначно свидетельствует о развитии патологии в твердой ткани. Обнаруженные нами особенности в профиле полосы Амид I биологических жидкостей ротовой полости совместно со спектральными маркерами развития кариозного процесса в дентине являются достоверными спектроскопическими сигнатурами патологии и могут быть детектированы с использованием десневой жидкости. Ключевые слова: ИК микроскопия, синхротронное излучение, кариес дентина, спектроскопические сигнатуры патологических процессов.