A Novel Approach toward Less Invasive Multiomics Gut Analyses: a Pilot Study

Abstract

In order to generate meaningful metabolomic and microbiome data, the method of sample collection is critical. This study utilizes and compares two methods for intestinal tissue collection for evaluation of metabolites and microbiomes, finding that using a brush to sample the microbiome provides valuable data. However, for metabolomics assessment, biopsy samples may still be required.

Методи Дослідження Мікробіоти Кишечника У Вагітних

“…Крім того, вартість пристроїв також є ключовим фактором для великих когортних досліджень. Нарешті, враховуючи, що підготовка кишечника має більший вплив на склад мікробіоти кишечника, нові технології найкраще виключають цю процедуру [10,11,[13][14][15][16][17][18] Наші власні спостереження показали, що у вагітних з ожирінням частіше зустрічається МК, який відповідає ІІ ступеню дисбіозу, ніж у контрольній групі, відповідно, 33,3 та 6,7 % (χ 2 =6,49, df=1, p=0,01). Випадків ІІІ ступеня дисбіозу не було виявлено в жодної вагітної.…”

Potential roles of gut microbes in biotransformation of natural products: An overview

“…By using the single-cell method, the physiological structure of gut microbes can be characterized to determine their metabolic activity ( Zheng et al, 2022 ). Metatranscriptomics (RNA-Seq) allows the direct analysis of gene expression profiles of microorganisms with strong metabolic activity in the human gut ( Berlinberg et al, 2022 ). The combination of single-cell methods, metatranscriptomics, and metagenomics has been used to identify and characterize the active subsets of gut microbiota and determine their metabolic responses to natural products.…”