Sambucus canadensis L. (Adoxaceae) é utilizada em tratamento medicinal de malária e dengue por populares do norte de Mato Grosso. Este trabalho teve por objetivo caracterizar morfoanatomicamente e fitohistoquímicamente os órgãos vegetativos dessa espécie, procurando indicar seus potenciais medicamentosos no tratamento de ambas as doenças. As raízes, caules e folhas de S. canadensis foram coletados no município de Alta Floresta, MT. Parte do material foi herborizado e identificado no Herbário da Amazônia Meridional, a outra parte foi fixado. Realizou-se secções transversais e paradérmicas nos órgãos, obtidos à mão livre, duplamente corados e montadas em lâminas histológicas. O material fresco foi submetido aos testes histoquímicos e fitoquímicos. A morfoanatomia apresentou características como, nectários extraflorais, células de secreção, tricomas tectores e glandulares. Neste estudo é possível verificar grande potencial medicamentoso em S. canadensis no tratamento de malária e dengue, pois apresenta flavonóides, taninos, terpenos, esteróides, saponinas e óleos essenciais.