Association of p53 Arg72Pro polymorphism with bladder cancer: A meta-analysis

Yang, Zhili; Nie, Shengjie; Zhu, Hui; Wu, Xiaoming; Jia, Shuting; Luo, Ying; Tang, Wenru

doi:10.1016/j.gene.2012.09.085

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“…The findings from our study confirm the lack of association of Arg72Pro in TP53 with risk of UCB in white Europeans (OR = 0.98, 95%CI 0.77–1.26, for ArgPro vs. ArgArg and OR = 0.91, 95%CI 0.75–1.09, for ProPro vs. ArgArg, p-value = 0.5 for overall effects) [13], [17]. However, we cannot rule out that lack of statistical power may hamper identification of a small effect association: even with its large sample size, the present study sample size could detect an OR≥1.3 per-allele for this SNP with 90% statistical power and at a significance level of 5%.…”

Section: Discussionsupporting

confidence: 85%

“…Overall, no association was observed by Jiang et al when comparing 1,601 cases and 1,948 controls from 10 studies, although a marginally significant association was seen among Asians (OR = 0.77, 95%CI 0.59–1.00, for ArgArg/ArgPro vs. ProPro) [13]. Discordant results have been recently reported combining data from 14 studies contributing with 2,176 cases and 2,798 controls (OR = 1.268, 95%CI 1.003–1.602, for ArgArg/ArgPro vs. ProPro among the Asian population) [17]. A large number of studies overlap between the two meta-analyses.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 90%

“…SNP rs1042522 (Arg72Pro) has been assessed in association with several cancers, among them UCB. However, the results of these studies are inconsistent [13], [14], [15], [16], [17], [18]. In contrast, an association between SNP rs710521 in TP63 , a TP53 family member, and risk of UCB has been convincingly replicated, pointing to the involvement of TP53 pathway members in UCB susceptibility [4].…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

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Genetic Variation in the TP53 Pathway and Bladder Cancer Risk. A Comprehensive Analysis

et al. 2014

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IntroductionGermline variants in TP63 have been consistently associated with several tumors, including bladder cancer, indicating the importance of TP53 pathway in cancer genetic susceptibility. However, variants in other related genes, including TP53 rs1042522 (Arg72Pro), still present controversial results. We carried out an in depth assessment of associations between common germline variants in the TP53 pathway and bladder cancer risk.Material and MethodsWe investigated 184 tagSNPs from 18 genes in 1,058 cases and 1,138 controls from the Spanish Bladder Cancer/EPICURO Study. Cases were newly-diagnosed bladder cancer patients during 1998–2001. Hospital controls were age-gender, and area matched to cases. SNPs were genotyped in blood DNA using Illumina Golden Gate and TaqMan assays. Cases were subphenotyped according to stage/grade and tumor p53 expression. We applied classical tests to assess individual SNP associations and the Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO)-penalized logistic regression analysis to assess multiple SNPs simultaneously.ResultsBased on classical analyses, SNPs in BAK1 (1), IGF1R (5), P53AIP1 (1), PMAIP1 (2), SERINPB5 (3), TP63 (3), and TP73 (1) showed significant associations at p-value≤0.05. However, no evidence of association, either with overall risk or with specific disease subtypes, was observed after correction for multiple testing (p-value≥0.8). LASSO selected the SNP rs6567355 in SERPINB5 with 83% of reproducibility. This SNP provided an OR = 1.21, 95%CI 1.05–1.38, p-value = 0.006, and a corrected p-value = 0.5 when controlling for over-estimation.DiscussionWe found no strong evidence that common variants in the TP53 pathway are associated with bladder cancer susceptibility. Our study suggests that it is unlikely that TP53 Arg72Pro is implicated in the UCB in white Europeans. SERPINB5 and TP63 variation deserve further exploration in extended studies.

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Section: Discussionsupporting

confidence: 85%

Section: Discussionmentioning

confidence: 90%

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

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Genetic Variation in the TP53 Pathway and Bladder Cancer Risk. A Comprehensive Analysis

et al. 2014

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“…Кілька досліджень показали, що поліморфізм Arg72Pro відіграє певну роль в інвазивності та прогресії [23,24], з іншого боку, повідомлялося про асоціацію поліморфізму саме з прогресуванням, а не виникненням раку [25]. Мета-аналіз, проведений Z. Yang et al [26], показав значну асоціацію між поліморфізмом Arg72Pro гена TP53 та підвищеним ризиком розвитку раку сечового міхура в жителів Азії, але не в представників європеоїдної раси.…”

Section: результати та обговоренняunclassified

Association of TP53 Arg72Pro polymorphism (rs1042522) with bladder cancer risk in the Ukrainian population

Mishchuk¹,

Kharkivska²,

Serga³

et al. 2018

Fakt. eksp. evol. org.

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Aim. To determine the frequency of TP53 polymorphic variants in bladder cancer patients and define possible association of this polymorphism with a bladder cancer in Ukrainians patients. Methods. The genotypes of TP53 gene at codon 72 were detected by PCR with allele specific primers. We investigated Arg72Pro polymorphism in 114 DNA samples of patients with bladder cancer. The PCR-amplified DNA products were subjected to electrophoresis in 3 % agarose. Results. The distribution of genotypes in group of patients with a bladder cancer was: Arg/Arg – 59.6 % (n=68), Arg/Pro – 40.4 % (n=46), Pro/Pro – 0 % (n=0). Genotype frequencies in patients (χ2=7.28, p=0.0007) weren’t in agreement with Hardy-Weinberg equilibrium. There were significant differences in the frequency of genotypes between the healthy individuals and the cancer group patients. Our result showed that patients with bladder cancer had a significantly higher frequency of Arg/Arg (F=42.7, p<0.05) and a lower frequency of Pro/Arg (F=40.9, p<0.05) compared to controls. Conclusions. Our study allows us to suggest that Arg/Arg polymorphic variant of TP53 is associated with the higher risk of bladder cancer development in the Ukrainian population (OR = 5,6, 95 % CI = 3.19 to 9.34, p < 0.0001). Keywords: TP53 gene, bladder cancer, polymorphism Arg72Pro, Ukrainian population.

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“…Além das mutações, polimorfismos genéticos descritos em TP53 também podem resultar em diferentes conformações proteicas. Dentre eles, um polimorfismo localizado no códon 72 do éxon 4 (rs1042522), que acarreta em uma substituição de Arg por Pro, tem sido associado a vários tipos de câncer Qiao, Hu, 2013;Yang et al, 2013;Zhao et al, 2013).…”

Section: Tp53 (Tumor Protein P53)unclassified

Associação entre polimorfismos em genes relacionados à resposta inflamatória e a suscetibilidade, progressão e prognóstico do câncer gástrico

Furuya¹

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A Seção de Agradecimentos com certeza é a parte mais importante da tese para mim, na qual eu gostaria de dedicar um longo tempo e muitas linhas!! Afinal de contas não se conquista um título de Doutora em Ciências sem a colaboração e a participação de inúmeras pessoas, no contexto profissional e talvez mais importante, na vida pessoal! Todos nós crescemos juntos uns com os outros ao longo dessa trajetória. Já aviso que será uma Seção bem extensa, mas não poderia perder a oportunidade de agradecer imensamente a todos que contribuíram de alguma forma para que eu pudesse chegar até aqui e para que esse trabalho fosse concluído!! As pessoas não estão listadas em ordem de importância!! Todas tiveram papel mais do que essencial nessa conquista!! Primeiramente agradeço a Deus! Acredito que a Ciência e a Fé caminham juntas e que uma não existe sem a outra!! Ao prof Dr Roger Chammas... um exemplo nato de pesquisador e docente, um ser humano fantástico, fonte de inspiração, por quem tenho uma enorme admiração e eterna gratidão!!!! Obrigada pela amizade, pelo carinho, pelo profissionalismo, por me ensinar a ser mais crítica, mais ética, por confiar no meu trabalho e na minha competência, por me incentivar, me motivar, por me abrir as portas, por me fazer enxergar sempre além, por me permitir fazer tudo isso com muito amor!! Obrigada por todas as grandes oportunidades que me ofereceu e por não me deixar desanimar mesmo nos momentos mais difíceis da vida pessoal e profissional!! Aos meus pais (Carmem e Jairo) e à minha irmã caçula (Thaisa), pois sem vocês a vida não faria o menor sentido!! Com certeza não existe amor maior no mundo do que esse que nos une!! Dedico a vocês todas as conquistas da minha vida!! Obrigada pelos ensinamentos, pelo exemplo, pelo apoio, pela compreensão, pela união nos momentos de alegrias e dificuldades, pelos consolos, pela torcida, por acreditarem em mim, por não me deixarem baixar a cabeça diante dos obstáculos da vida e por fazerem tudo isso simplesmente valer a pena!! Vocês são os únicos que nunca desistiram de mim e é POR vocês e COM vocês que eu vivo todas as batalhas!! Amo muito vocês!! Aos médicos cirurgiões (Dr Ulysses, Marcus Kodama e Carlos Jacob) que me auxiliaram em toda a parte clínica desse trabalho. Obrigada pela paciência e por me ensinarem tanto sobre câncer gástrico!! A todos os pesquisadores que colaboraram (direta e indiretamente) e a todas as equipes multidisciplinares envolvidas na execução desse trabalho!! Só quem esteve envolvido sabe o que se passa por trás dos bastidores!! Às agências financiadoras que nos proporcionaram a oportunidade de alcançar esses resultados e, agora, divulgá-los à comunidade científica!! A todos os pacientes que participaram do estudo e seus familiares... vocês são a fonte motivadora por trás de nossas pesquisas!! Obrigada Rossana pelos "insights" estatísticos que me ajudaram a conduzir e finalizar algumas das análises!! Um agradecimento especial à Michele, com quem busco diariamente não só a evolução científica, mas também a espiritual!! Sua colabor...

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Association of p53 Arg72Pro polymorphism with bladder cancer: A meta-analysis

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Genetic Variation in the TP53 Pathway and Bladder Cancer Risk. A Comprehensive Analysis

Genetic Variation in the TP53 Pathway and Bladder Cancer Risk. A Comprehensive Analysis

Association of TP53 Arg72Pro polymorphism (rs1042522) with bladder cancer risk in the Ukrainian population

Associação entre polimorfismos em genes relacionados à resposta inflamatória e a suscetibilidade, progressão e prognóstico do câncer gástrico

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