Objetivo. Evaluar preliminarmente in vitro algunas propiedades probióticas de dos cepas nativas de S.cerevisiae. Materiales y métodos. Las cepas fueron utilizadas en ensayos de tolerancia a sales biliares, pH, temperatura, adherencia a Salmonella spp., E.coli y Shigella spp., y antagonismo. Se realizó un diseño factorial 33 x 3, con tres niveles de cada factor (cepa, pH y concentración inicial de sustrato) por triplicado, para establecer las condiciones de cultivo de cada cepa. Como control se empleó una cepa comercial (B). La cepa seleccionada se empleó para la producción en biorreactor de 2L; la biomasa fue sometida a secado por temperatura; al producto resultante se le determinó concentración de N2 y la viabilidad celular. Resultados. La cepa A (obtenida de caña de azúcar), toleró pH 3 ± 0.2, 0.3% (p/v) de sales biliares y 42oC. El ANOVA del diseño factorial reportó diferencias significativas entre los 27 ensayos (p≤0.05), el análisis de superficies reportó que la interacción entre los factores cepa y Sustrato (S0) son significativos, sugiriendo para la optimización la cepa A y concentraciones crecientes de S0. Los resultados se reprodujeron en biorreactor con mx 0.31h-1, td 2.18h y Y(x/s) 0.126g/g; la biomasa seca obtenida fue viable y reportó entre 6.3 y 6.9% N2/g. Conclusiones. Se identificaron levaduras nativas con propiedades probióticas como tolerancia a pH, sales biliares, temperatura y adherencia a Salmonella spp., E.coli y Shigella spp.