A doença de Chagas causada pelo parasita Trypanosoma cruzi acomete milhões de pessoas no mundo e não conta com um medicamento de ação efetiva para o seu tratamento etiológico. As drogas disponíveis, o nifurtimox e o benznidazol possuem índices de cura baixos com efeitos colaterais e toxidade que dificultam a adesão dos pacientes à terapia. Este fato impulsiona a busca por alternativas de tratamento que sejam mais efetivas e menos agressivas. Sendo assim, este trabalho teve como objetivo a avaliação dos efeitos clínicos apresentados por Rattus norvergicus infectados por T. cruzi e tratados com soluções ultradiluídas de Lycopodium clavatum ou Phosphorus. O estudo envolveu 93 ratos com quarenta e cinco dias de idade infectados intraperitonealmente com 5x106 formas tripomastigotas sanguíneos da cepa Y de T. cruzi, distribuídos nos grupos: Sadio SD (n=13) - controle não infectado e não tratado, grupo CI (n=27) - controle infectado e tratado com solução hidroalccólica 7% (etanol – água), grupo LY diluição 1:1x1026 (n=27) - infectado e tratado com Lycopodium, grupo PH diluição 1:1x1026 (n=26) - infectado e tratado com Phosphorum. Os animais foram avaliados clinicamente através dos parâmetros peso, temperatura, consumo de água e ração, quantidade de excretas, diâmetro e comprimento intestinal, aspecto da pelagem e consistência das fezes. Este estudo mostrou que os parâmetros utilizados foram importantes para a definição clínica da infecção de Rattus novergicus, linhagem Wistar pelo T. cruzi. Mostrou que os medicamentos LY e PH apresentam efeitos benéficos na evolução da clínica dos animais tratados. A utilização de Lycopodium clavatum e Phosphorus diluídos na proporção de 1:1x1026, apresentaram efeitos diferentes. Oito e seis parâmetros de quatorze analisados mostraram efeitos positivos para LY e PH, respectivamente. Os parâmetros consumo de água e ração, quantidade de excretas, diarreia, alopecia difusa e comprimento intestinal apresentaram diferenças significativas em relação ao controle infectado mostrando que mais estudos são necessários com o uso de medicamentos ultradiluídos na infecção pelo T. cruzi.