Caracterização molecular de cianobactérias isoladas de ecossistema manguezal do Estado de São Paulo e identificação de produtos naturais

Silva, Caroline Souza Pamplona da

doi:10.11606/t.11.2010.tde-02082010-165249

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“…Os estudos sobre cianobactérias na costa Atlântica brasileira, no entanto, são escassos e restringem-se, essencialmente, a levantamentos florísticos por meio de observações em microscopia óptica das espécies bentônicas (BAETA-NEVES;TRIBUZI, 1992;BRANCO et al, 1996;CRISPINO;SANT´ANNA, 2006). Estudos recentes, realizados no Laboratório de Ecologia Molecular de Cianobactérias (CENA/USP), introduziram, pela primeira vez, análises dependentes e independentes de cultivo no estudo da diversidade de cianobactérias nesse ambiente SILVA, 2010;RIGONATO, 2010).…”

Section: Ambiente Costeiro E De Manguezalunclassified

“…Neste trabalho, cinquenta linhagens de cianobactérias isoladas de ambiente costeiro SILVA, 2010) foram analisadas. Uma vez que as linhagens estudadas foram isoladas de um ambiente pouco explorado, levantou-se a hipótese de que tais linhagens são promissoras do ponto de vista biotecnológico, podendo apresentar moléculas com atividades biológicas interessantes, bem como produzir cianotoxinas.…”

Section: Introductionunclassified

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Cianobactérias de ambiente costeiro: filogenia, prospecção gênica e química de moléculas bioativas

Vaz¹

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Andreote e à Elaine Crespim, pela colaboração nas atividades científicas, ensinamentos e, principalmente, pela amizade. À Talita Schiavolin, estudante de iniciação científica, por ter ser tornando, neste último ano, o meu braço direito, auxiliando nas diversas tarefas dentro do laboratório. Um agradecimento especial ao grande amigo Diego Bonaldo Genuário, pelos ensinamentos, discussões quase infinitas sobre os mais variados temas. Agradeço ainda pela companhia constante. Aos amigos e colegas do Programa de Pós-graduação em Microbiologia Agrícola, e todos aqueles que participaram da minha vida nestes últimos quatro anos, em especial, à Lucélia Borgo. Aos amigos de Viçosa, inesquecíveis, Victor, Luciano, Gilberto e Matheus (CSF) e Lucas Paolucci. Por fim e, não menos importante, gostaria de agradecer aos meus pais, por tudo que eles representam, pelo amor incondicional durante toda minha vida e por serem sempre pacientes em todos os momentos. Agradecimento mais que especial aos meus irmãos, pela amizade, e companheirismo em todos os momentos, e à minha grande avó, Raime, pela presença marcante. Esse agradecimento é o mínimo que posso fazer em retribuição a tudo de bom que recebi de vocês. Obrigado!

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Section: Ambiente Costeiro E De Manguezalunclassified

Section: Introductionunclassified

Cianobactérias de ambiente costeiro: filogenia, prospecção gênica e química de moléculas bioativas

Vaz¹

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“…A diversidade de cianobactérias em manguezais tem sido explorada por vários autores (BRANCO; SILVA; SANTANNA, 1994;BRANCO et al, 1996a;BRANCO et al, 1997;GENUÁRIO, 2010;SANTANNA, 1995;SILVA, 2010 HONDA 2008;MITSUI et al, 1986;MITSUI et al, 1987;SPILLER;SHANMUGAM, 1987) apesar da célula especializada para a fixação do nitrogênio, o heterócito, estar ausente neste gênero, eles separam os dois processos temporalmente, fazendo fotossíntese durante o dia e fixação de nitrogênio à noite, em um ciclo circadiano bem definido (FALCÓN et al, 2002;GOLDEN et al, 1997;LEÓN; (área sob ação direta das marés), a riqueza e a abundância diminuíram sensivelmente em relação à supralitorânea e a autora não encontrou cianobactérias na zona infralitorânea (área que só fica emersa em marés excepcionalmente baixas). Branco et al (1996aBranco et al ( , 1996bBranco et al ( e 1997 (CARTER, 1933;DOR, 1984;KOSTER, 1960;LAMBERT;NAIDOO, 1989;NOGUEIRA;FERREIRA-CORREIA, 2001;SANTANNA, 1995;SANTANNA;BICUDO;PEREIRA, 1983;SANTANNA et al, 1985SANTANNA et al, , 1995SANTANNA;SIMONETTI, 1992;SILVA, 1991 MAZARD et al, 2004;ZEHR et al, 1995;ZEHR et al, 2001;ZANI, 1998), e também em solo (OL...…”

Section: Dgge E Biblioteca Do Gene 16s Rnarunclassified

Diversidade de cianobactérias em manguezais do Estado de São Paulo

Rigonato¹

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“…Para tal, uma alíquota de 2 mL da cultura foi homogeneizada e transferida para uma membrana de filtro de nitrocelulose (8 μm). Em seguida, as células foram lavadas adicionando-se: 20 mL de água ultrapura, 5 mL de Extran® (Merck, Darmstadt, Germany) 0,1%, 20 mL de solução de lavagem (NaCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM pH 7.5, EDTA 5 mM pH (SILVA, 2010;CHATCHAWAN et al, 2012;BHUVANESHWARI et al, 2016;CHAKRABORTY et al, 2018).…”

Section: Purificação Da Culturaunclassified

Taxonomia, genômica e potencial funcional da cianobactéria >i<Oxynema>/i< sp. CENA135

Castillo¹,

Angélica²

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e em especial a Fernanda Rios Jacinavicius pela guia, ensinamentos e disponibilidade na realização de análises. Às funcionarias do laboratório Ana Paula Dini Andreote e Renata Beatriz Cruz, pelas distintas atividades que realizam no laboratório e ainda assim me forneceram apoio. Aos colegas do laboratório, amigos, com todo carinho e gratidão para Bruno Evangelista de Souza, Taiane Fernanda Barradas, Endrews Delbaje, Caroline Rosa de Carvalho e Rafael Barty Dextro. Em especial para Juliana dos Santos Costa e Thierry Alexandre Pellegrinetti pelo companherismo e o suporte em momentos cinzentos. A nossa Pós-doutoranda Simone Cotta e às estagiárias Julia Polezi Formagio e Lara Losovoi pela juda recebida. Ao pesquisador Danillo Alvarenga pelos conselhos fornecidos A Guilherme K. Hosaka, pelo amor, amizade, companhia, ensinamentos, apoio inestimável durante minha formação, e pelo Pisco. A sua familia pelas atenções recebidas e as sempre interessantes conversas culturais. A Rodolfo Silva e Fernando Matias, pela amizade, apoio e aventuras neste lindo país. Ao Programa de Pós-Graduação em Microbiologia Agrícola e ao Serviço da Pós-Graduação, em especial a Maria Solizete Granziol Silva e Alexandre Joviniano dos Santos, por todo o auxílio e orientação fornecida. O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior-Brasil (CAPES)-Código de Financiamento 001 ABSTRACT Taxonomy, genomics and functional potential of the cyanobacteria Oxynema sp. CENA135 Oxynema is a derivated genus from the polyphyletic Phormidium and with few registered species, which were found in mangroves, marine or high salinity environments. The taxonomic and genomic informations are almost nonexisting for this genus, with a few exceptions of 16S rRNA and 16S-23S ITS sequences available at databases. Previous studies performed with Oxynema sp. CENA135 isolated from a Brazilian mangrove showed its potential to synthesize siderophores, aliphatic hydrocarbons, anticancer and antibiotic substances, besides its effective degradation of some types of textile dyes. In this work, the strain Oxynema sp. CENA135 was analyzed under a polyphasic approach (morphology, habitat, phylogenomics, phylogeny of the 16S rRNA gene and secondary structure of 16S-23S ITS), including the search for genes or gene clusters related to the biosynthesis of natural products and the detection of associated bacteria. After morphological characterization using an optic and a scanning microscopes, the genomic sequencing was performed from a mate pair library at the HiSeq (Illumina) platform. This is the first genome of the genus Oxynema and, therefore, for its assembly it was used a de novo method resulting in 11 scaffolds in a total size of 6.2 Mbp, with N50 of 3,591,108 pb, GC content of 51.6% and average coverage of 190x. The checkM software estimated a high completeness of the genome (99.29%) and few contaminations (1.22%). Genome mining revealed a biorremediation potential due to the presence of genes related to resistance of copper,...

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Caracterização molecular de cianobactérias isoladas de ecossistema manguezal do Estado de São Paulo e identificação de produtos naturais

Abstract: Aos meus pais, Mariana e Carlos, e à minha irmã, Anne, pelo amor, carinho e apoio em todos os momentos de minha vida.

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Cianobactérias de ambiente costeiro: filogenia, prospecção gênica e química de moléculas bioativas

Cianobactérias de ambiente costeiro: filogenia, prospecção gênica e química de moléculas bioativas

Diversidade de cianobactérias em manguezais do Estado de São Paulo

Taxonomia, genômica e potencial funcional da cianobactéria >i<Oxynema>/i< sp. CENA135

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