Os flavonóides presentes nos extratos de cana-de-açúcar (Saccharum officinarum) foram analisados por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS), e o estudo da rota de fragmentação dos flavonóides selecionados foi realizado utilizando a espectrometria de massas com aceleração ortogonal por tempo de vôo e ionização eletrospray (ESI-oa-ToF MS). Sete flavonas C-e O-glicosiladas foram identificadas nos extratos: schaftosídeo, isoschaftosídeo, luteolina-8-C-(ramnosilglicosídeo), vitexina, orientina, tricina-7-O-neohesperidosídeo e tricina-7-O-glicosídeo. Destas, cinco foram identificadas sem comparação direta com seus respectivos padrões. O método descrito também permitiu a diferenciação das 6-C e 8-C flavonas isoméricas, schaftosídeo e isoschaftosídeo. A combinação dos dados de fragmentação e a medida de massa exata mostraram ser complementares às técnicas de HPLC-UV-MS previamente utilizadas para discriminação de isômeros nos estudos da cana-de-açúcar.The flavonoids present in sugarcane (Saccharum officinarum) extracts were analyzed by liquid chromatography -mass spectrometry (LC-MS), and a study of the fragmentation patterns of selected flavonoids was conducted using orthogonal acceleration time-of-flight electrospray ionization mass spectrometry (ESI-oa-ToF MS). Seven C-and O-glycosylflavones were identified in the extracts, namely, schaftoside, isoschaftoside, luteolin-8-C-(rhamnosylglucoside), vitexin, orientin, tricin-7-O-neohesperidoside and tricin-7-O-glucoside. Of these, five were identified in the absence of direct comparison with their respective standards. The described method also permitted the differentiation of the 6-C and 8-C isomeric flavones, schaftoside and isoschaftoside. The combination of fragmentation data and exact mass measurement showed to be complimentary to the HPLC-UV-MS techniques previously utilized for isomers discrimination in sugarcane studies.