Commercially available assays for multiplex detection of alpha human papillomaviruses

Poljak, Mario; Kocjan, Boštjan J.

doi:10.1586/eri.10.104

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“…Negli ultimi anni un ruolo di primo piano nelle MST lo svolge la diagnostica molecolare dell'HPV, che sta diventando il test di prima scelta per lo screening della cervice uterina (9,13,37). I metodi NAATs per la ricerca di HPV sono numerosissimi, con regioni target e metodiche diverse (35). Il test più utilizzato è l'Hybrid Capture 2 (HC2) della Digene Corp., approvato dalla Food and Drug Administration (FDA) nel 2003 per la rilevazione dell'infezione da HPV ad alto rischio per il triage delle donne con citologia ASCUS e come test di screening di primo livello, da associarsi alla citologia tradizionale, per le donne di età superiore ai 30 anni (35).…”

Section: Discussioneunclassified

“…I metodi NAATs per la ricerca di HPV sono numerosissimi, con regioni target e metodiche diverse (35). Il test più utilizzato è l'Hybrid Capture 2 (HC2) della Digene Corp., approvato dalla Food and Drug Administration (FDA) nel 2003 per la rilevazione dell'infezione da HPV ad alto rischio per il triage delle donne con citologia ASCUS e come test di screening di primo livello, da associarsi alla citologia tradizionale, per le donne di età superiore ai 30 anni (35). Questo test permette la rilevazione di 13 genotipi di HPV ad alto rischio e 5 a basso rischio attraverso l'ibridazione del campione con una miscela di sonde; non permette l'esatta determinazione del tipo di HPV presente nel campione, ma esprime solamente la presenza o assenza degli HPV testati.…”

Section: Discussioneunclassified

“…Praticamente inesistenti i test di diagnostica quantitativa in RT-PCR che hanno un'importanza nel follow-up del trattamento. Per la diagnostica del Papillomavirus umano ad alto rischio oncogeno (HR-HPV), numerose sono invece le metodiche NAATs per la rilevazione e la genotipizzazione basate sull'amplificazione del DNA virale delle regioni virali L1 ed E1 (35). Pochi i test di diagnostica basati sull'amplificazione della regione codificante per le oncoproteine E6 ed E7, in grado di rilevare anche il DNA virale integrato, forma altamente frequente nei carcinomi e nelle lesioni intraepiteliali di alto grado (33).…”

Section: Introduzioneunclassified

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Frequency of sexually transmitted diseases and main methodological implications

et al. 2013

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INTRODUZIONELe infezioni sessualmente trasmesse (MST) hanno un'incidenza di circa 340 milioni di nuovi casi ogni anno (48); se non trattate, molte di esse possono produrre infezioni con gravi complicanze, quali infertilità, aborti precoci e malattie neonatali di grado severo (18,24). I costi socio-economici di queste infezioni e delle loro complicanze sono elevati; lo screening per la prevenzione primaria del cancro della cervice e gli interventi per il trattamento e follow-up delle neoplasie cervicali intraepiteliali di grado lieve (CIN 1), moderato (CIN 2) e grave (CIN 3), il trattamento dell'infertilità, la cura della cecità e delle infezioni polmonari nei neonati, rappresentano una larga porzione dei costi sanitari complessivi. Quantificare l'incidenza e la distribuzione di questi patogeni nella popolazione, mediante l'investimento in opportune strategie di controllo e prevenzione, è importante per ridurre la morbilità e la mortalità correlata a questo tipo di infezioni con ricadute, sicuramente, in termini di qualità di vita per i pazienti ma anche in termini di spesa sanitaria più complessa da calcolare. Numerosi sono i test di amplificazione degli acidi nucleici (NAATs) in Real-Time polymerase chain reaction (RT-PCR) per la rivelazione di Chlamydia trachomatis e Neisseria gonorrhoeae (11,23,32,45) mentre poco implementati quelli per la rilevazione di Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum e Ureaplasma parvum, nonostante numerosi studi abbiano dimostrato una maggiore sensibilità delle metodiche 2,28,41,44). Diversi sono i laboratori che stanno implementando la diagnostica molecolare e impiegano le metodiche colturali solo quando è necessario l'antibiogramma. Praticamente inesistenti i test di diagnostica quantitativa in RT-PCR che hanno un'importanza nel follow-up del trattamento. Per la diagnostica del Papillomavirus umano ad alto rischio oncogeno (HR-HPV), numerose sono invece le metodiche NAATs per la rilevazione e la genotipizzazione basate sull'amplificazione del DNA virale delle

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Section: Discussioneunclassified

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Frequency of sexually transmitted diseases and main methodological implications

et al. 2013

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“…also be used to detect low-risk HPV (lrHPV) genotypes. The advantage of the hc2 test is its long-standing and extensive use in clinical practice; the disadvantage is the potential for cross-reactivity with other, usually lrHPV genotypes, which can lead to false-positive results [1]. In the last decade numerous new hrHPV tests have come on the market based on DNA detection using polymerase chain reaction (PCR) assays.…”

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confidence: 99%

“…Most commonly available, commercial PCR-based tests have therefore adapted their detection thresholds accordingly. The disadvantage of PCR-based assays is the limited clinical experience, although numerous studies of these tests have been done in recent years [1,2].…”

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confidence: 99%

Importance of HPV Genotyping for the Screening, Therapy and Management of Cervical Neoplasias

Jentschke

Soergel

Hillemanns

2012

Geburtsh Frauenheilk

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In the last decade, the detection of human papillomaviruses (HPV) has become increasingly important in cervical cancer screening and the treatment of cancer precursors. HPV screening is recommended for the further evaluation of abnormal Pap tests or during follow-up after treating precancerous lesions. Several randomised controlled studies have shown that screening for cervical cancer using HPV detection can be more effective than cytology alone. Genotyping of different high-risk HPV (hrHPV) types obtained from smear tests has not yet gained widespread acceptance in clinical practice. However, significant differences have been noted in the oncogenicity of hrHPV genotypes. HPV 16 is by far the most common and oncogenic genotype. Genotyping of hrHPV could be helpful for the risk stratification of HPV-positive women.

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Comparison of the accuracy of Hybrid Capture II and polymerase chain reaction in detecting clinically important cervical dysplasia: a systematic review and meta‐analysis

et al. 2013

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The effectiveness of screening programs for cervical cancer has benefited from the inclusion of Human papillomavirus (HPV) DNA assays; which assay to choose, however, is not clear based on previous reviews. Our review addressed test accuracy of Hybrid Capture II (HCII) and polymerase chain reaction (PCR) assays based on studies with stronger designs and with more clinically relevant outcomes. We searched OvidMedline, PubMed, and the Cochrane Library for English language studies comparing both tests, published 1985–2012, with cervical dysplasia defined by the Bethesda classification. Meta-analysis provided pooled sensitivity, specificity, and 95% confidence intervals (CIs); meta-regression identified sources of heterogeneity. From 29 reports, we found that the pooled sensitivity and specificity to detect high-grade squamous intraepithelial lesion (HSIL) was higher for HCII than PCR (0.89 [CI: 0.89–0.90] and 0.85 [CI: 0.84–0.86] vs. 0.73 [CI: 0.73–0.74] and 0.62 [CI: 0.62–0.64]). Both assays had higher accuracy to detect cervical dysplasia in Europe than in Asia-Pacific or North America (diagnostic odd ratio – dOR = 4.08 [CI: 1.39–11.91] and 4.56 [CI: 1.86–11.17] for HCII vs. 2.66 [CI: 1.16–6.53] and 3.78 [CI: 1.50–9.51] for PCR) and accuracy to detect HSIL than atypical squamous cells of undetermined significance (ASCUS)/ low-grade squamous intraepithelial lesion (LSIL) (HCII-dOR = 9.04 [CI: 4.12–19.86] and PCR-dOR = 5.60 [CI: 2.87–10.94]). For HCII, using histology as a gold standard results in higher accuracy than using cytology (dOR = 2.87 [CI: 1.31–6.29]). Based on higher test accuracy, our results support the use of HCII in cervical cancer screening programs. The role of HPV type distribution should be explored to determine the worldwide comparability of HPV test accuracy.

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Commercially available assays for multiplex detection of alpha human papillomaviruses

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Frequency of sexually transmitted diseases and main methodological implications

Frequency of sexually transmitted diseases and main methodological implications

Importance of HPV Genotyping for the Screening, Therapy and Management of Cervical Neoplasias

Comparison of the accuracy of Hybrid Capture II and polymerase chain reaction in detecting clinically important cervical dysplasia: a systematic review and meta‐analysis

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