Introdução: A pandemia de COVID-19 impactou na prestação de serviços à saúde aos pacientes portadores de doenças crônicas e o Medication Therapy Management (MTM-PC), parte integrante do cuidado farmacêutico, pode acarretar melhora dos parâmetros clínicos impactados pela pandemia. O objetivo deste estudo foi avaliar o impacto clínico do cuidado farmacêutico na hipertensão arterial sistêmica (HAS) e diabetes mellitus (DM) diante às mudanças impostas pela pandemia de COVID-19 no âmbito da atenção primária à saúde. Métodos: Trata-se de um estudo quase-experimental, single arm, do tipo antes e depois, com a coleta de dados de 01 julho de 2019 a 31 de outubro de 2022. Foram incluídos no estudo dados de pacientes do consultório farmacêutico da Farmácia Universitária- UFJF que foram divididos em pré-pandemia e pandemia, considerando o baseline e os dados relativos à reintrodução do atendimento presencial no consultório como endpoint. Foram coletados dados de pressão arterial, perfil lipídico, glicemia capilar, uso de estatinas e ácido acetilsalicílico, risco cardiovascular e dados psicossociais, consequências do isolamento social na saúde mental, prescrição de medicamentos e hábitos de vida. Os dados foramanalisados no software MINITAB v19, considerando o nível de significância de 5%. Resultados: Durante a pandemia sem o MTM-PC verificou-se que a pressão arterial e o HDL aumentaram, PAS 117,5±8,86 e 134,75±12,43; PAD 71,25±3,54 e 83,25±11,65; HDL 45,25± 7,80 e 52,38±12,52. Comparativamente, verificou-se que os valores de pressão arterial se mantiveram e os parâmetros de hemoglobina glicada e HDL melhoraram com o MTM-PC, HbA1c 7,890±1,798, [p=0,028] e 7,325±1,30; HDL48,00±6,00 e 59,00±10,56, [p=0,020]. Consequentemente, refletiu-se no aumento do risco cardiovascular pela pandemia, tanto na escala global 13,69±8,08 para 22,38±7,28, quanto otimizada, 8,35± 6,71 para 16,10±5,83, [p=0,38], havendo a quebra de tendência no aumento do risco com o MTM-PC. A carga terapêutica dos medicamentos utilizados para hipertensão e diabetes se manteve abaixo do valor limite de 75%. Conclusão: Evidenciou-se que a pandemia modificou parâmetros como pressão arterial e risco cardiovascular. E que o MTM-PC foi capaz de reduzir o impacto da pandemia na hemoglobina glicada, melhorar os níveis de colesterol HDL e quebrar uma tendência do aumento do risco cardiovascular.