Cryptic species and species pairs in lichens: A discussion on the relationship between molecular phylogenies and morphological characters

Abstract

ResumenCrespo, A. & Pérez-Ortega, S. 2009. Especies crípticas y pares de especies en líquenes: una discusión sobre la relación entre la filogenia molecular y los caracteres morfológicos. Anales Jard. Bot. Madrid 66S1: 71-81 (en inglés).Como en otras disciplinas, el impacto producido por la filogenia molecular en el conocimiento de los hongos liquenizados ha producido avances y cambios conceptuales importantes. Esto ha sido especialmente cierto en la sistemática y ha afectado de una manera muy notable en aspectos relacionados con la delimitación de las especies. En muchos casos los datos moleculares han verificado las hipótesis tradicionalmente aceptadas en relación con la definición y el reconocimiento de especies, pero en otros han producido conflictos con el concepto morfológico todavía en uso. Este trabajo trata de los recientes progresos en dos direcciones principales: (i) las especies crípticas, es decir, dos o más linajes independientes que exhiben o aparentan una morfología similar; y (ii) los pares de especies, que son especies con morfología similar pero que exhiben diferentes modos de reproducción. Ambos conceptos tienen en común la falta de correlación entre datos filogenéticos y morfológicos, al menos en lo que se refiere a los caracteres normalmente utilizados en la sistemática de líquenes. Hemos analizado la literatura disponible sobre especies crípticas y pares de especies, centrando los ejemplos preferentemente en la familia Parmeliaceae (Lecanoromycetes, Ascomycota). En los hongos liquenizados, los datos moleculares han demostrado reiteradamente la existencia de especies crípticas, pero los investigadores han sido a menudo muy prudentes a la hora de reconocer como tales los nuevos táxones que se vislumbran. De hecho, las investigaciones se han esforzado en la observación cuidadosa de caracteres morfológicos informativos o de caracteres ecológicos o geográficos; ello está proporcionando un buen apoyo para un sólido planteamiento biológico que va parejo al reconocimiento formal de las especies crípticas. Al contrario, en el caso de los pares de especies, raro es el par de especies, entre los estudiados, en que se haya podido confirmar que realmente se trata de linajes independientes. Por As with most disciplines in biology, molecular genetics has revolutionized our understanding of lichenized fungi. Nowhere has this been more true than in systematics, especially in the delimitation of species. In many cases, molecular research has verified long-standing hypotheses, but in others, results appear to conflict with existing morphological species concepts. This work reports on recent progress regarding two main issues: (i) cryptic species, i.e., two or more independent lineages exhibiting similar morphology; and (ii) species pairs, two species with similar morphology but exhibiting different reproductive modes. Both concepts have in common a lack of correlation between phylogenetic and morphological data, at least for characters normally used in lichen systematics. We review the available literature on...

Hidden diversity in the morphologically variable script lichen (Graphis scripta) complex (Ascomycota, Ostropales, Graphidaceae)

“…Traditional taxonomic treatments within the family largely rely on chemistry, apothecium shape, and ascospore morphology (Staiger 2002). Molecular data on other lichenized fungal lineages have shown that the classification based on these characters usually underestimates the number of distinct lineages under a single taxonomic name (Crespo and Lumbsch 2010;Crespo and Ortega 2009;Hodkinson and Lendemer 2011;McCune and Schoch 2009;Ruprecht et al 2010;Spribille et al 2011;Vondrák 2012;Wedin et al 2009). Within Graphidaceae, traits traditionally used for classification were shown to have evolved independently several times (Lumbsch et al 2014;Rivas Plata and Lumbsch 2011).…”

The Dynamic Discipline of Species Delimitation: Progress Toward Effectively Recognizing Species Boundaries in Natural Populations

“…The topic of cryptic species, cases where two or more distinct species-level lineages are erroneously classified (and hidden) under one nominal taxon (Bickford et al 2007), has been frequently reviewed for lichen-forming fungi (Lumbsch and Leavitt 2011;Crespo and Lumbsch 2010;Crespo and Pérez-Ortega 2009;Printzen 2009). Although novel diagnostic phenotypic characters may potentially be identified corroborating "cryptic" species, these previously unrecognized lineages generally remain difficult to classify within a traditional phenotype-based taxonomy (Leavitt et al 2013c, d).…”

Anatase as an alternative application for preventing biodeterioration of mortars: Evaluation and comparison with other biocides

“…This is because, apparently, database of lichens are far from complete and, therefore molecular identifications, are in some cases incorrect. Crespo and Pérez-Ortega (2009) reported that there is a lack of correlation between phylogenetic and morphological data, at least for characters normally used in lichen systematics. Table 4 Chlorophyll a values (mean of triplicates) obtained by spectro-fluorescence and by extraction method for AC mortar after inoculation, after incubation and after the application of the biocides.…”