Development of Upper Respiratory Tract Microbiota in Infancy is Affected by Mode of Delivery

Bosch, Astrid A. T. M.; Levin, Evgeni; Houten, Marlies A. van; Hasrat, Raiza; Kalkman, Gino; Biesbroek, Giske; Piters, Wouter A A de Steenhuijsen; Groot, Pieter-Kees C. M. de; Pernet, Paula; Keijser, Bart J. F.; Sanders, Elisabeth A. M.; Bogaert, Debby

doi:10.1016/j.ebiom.2016.05.031

Cited by 223 publications

(258 citation statements)

References 34 publications

Supporting

Mentioning

217

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…This pattern contrasts with the nasopharyngeal microbiome in healthy infants <6 months of age that we and others have previously described, in which Haemophilus tends to be less common and Staphylococcus is one of the most predominant genera [3,10,12,13]. Interestingly, early-life colonization with Haemophilus influenzae has been associated with a proinflammatory immune response and the development of childhood asthma [4,6,14].…”

Section: Discussioncontrasting

confidence: 42%

Differences in the Nasopharyngeal Microbiome During Acute Respiratory Tract Infection With Human Rhinovirus and Respiratory Syncytial Virus in Infancy

Rosas‐Salazar¹,

Shilts

Tovchigrechko

et al. 2016

J Infect Dis.

View full text Add to dashboard Cite

Respiratory viruses alter the nasopharyngeal microbiome and may be associated with a distinct microbial signature. To test this hypothesis, we compared the nasopharyngeal microbiome of 135 previously healthy infants with acute respiratory infection due to human rhinovirus (HRV; n = 52) or respiratory syncytial virus (RSV; n = 83). The nasopharyngeal microbiome was assessed by sequencing the V4 region of the 16S ribosomal RNA. Respiratory viruses were identified by quantitative reverse-transcription polymerase chain reaction. We found significant differences in the overall taxonomic composition and abundance of certain bacterial genera between infants infected with HRV and those infected with RSV. Our results suggest that respiratory tract viral infections are associated with different nasopharyngeal microbial profiles.

show abstract

Section: Discussioncontrasting

confidence: 42%

Differences in the Nasopharyngeal Microbiome During Acute Respiratory Tract Infection With Human Rhinovirus and Respiratory Syncytial Virus in Infancy

Rosas‐Salazar¹,

Shilts

Tovchigrechko

et al. 2016

J Infect Dis.

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Однак відомі факто-ри ризику не можуть повною мірою пояснити хро-нічні або рецидивні порушення стану респіратор-ного здоров'я у таких дітей [6]. Згідно з сучасними поглядами, інфекційна респіраторна патологія роз-глядається в аспекті вірусно-бактеріально-імунної взаємодії; парадигма «один збудник -одна хво-роба» сприймається критично, і все більше дослід-ників вказують на комплексний вплив мікробіому респіраторного тракту та стану імунної резистент-ності на виникнення та розвиток хвороб дихальних шляхів [7,8]. Так, доведено, що мікробіотичний профіль дихальних шляхів у ранньому дитинстві асоційований з ризиком, частотою та тяжкістю ін-фекційної респіраторної патології в подальшому житті; рання взаємодія інфекційних агентів, напри-клад вірусів, з респіраторною мікробіотою модулює імунну відповідь дитини, що потенційно впливає на перебіг респіраторних захворювань і майбутнє респіраторне здоров'я дитини [6].…”

Section: вступunclassified

Стан Місцевого Захисту Та Особливості Мікробної Колонізації Слизових Оболонок Верхніх Дихальних Шляхів У Дітей Із Бактеріальними Ускладненнями ГРВІ

Bolbot¹,

Карпенко²,

Shvarackaja³

et al. 2021

View full text Add to dashboard Cite

Актуальність. Гострі респіраторні вірусні інфекції (ГРВІ) є одними з найбільш частих захворювань дитячого віку. Відомо, що певний контингент дітей при ГРВІ схильний до розвитку повторних бактеріальних ускладнень; така схильність може підтримуватись у тому числі порушеннями локальної імунної відповіді. Інфекційна респіраторна патологія на даний час розглядається комплексно в аспекті вірусно-бактеріально-імунної взаємодії, тож дослідження зв’язків між мікробіологічними й імунологічними факторами може сприяти розробці цільових терапевтичних і профілактичних заходів, що можуть підвищувати ефективність ведення таких пацієнтів. Мета дослідження. Вивчення стану місцевої резистентності слизових оболонок верхніх дихальних шляхів у дітей, які схильні до повторних бактеріальних ускладнень ГРВІ, у зв’язку з етіологічною структурою таких ускладнень та особливостями мікробної колонізації слизових оболонок верхніх відділів респіраторного тракту. Матеріали та методи. Обстежено 214 дітей віком від 3 до 18 років, хворих на ГРВІ з розвитком гострого гнійного середнього отиту (ГСО) або гострого бактеріального риносинуситу (ГРС). До І групи ввійшло 128 дітей з епізодичними бактеріальними ускладненнями ГРВІ в анамнезі, у ІІ групу включено 86 дітей із рецидивним перебігом бактеріальних ускладнень. Було виконано мікробіологічне дослідження ексудату з вогнища запалення, а також визначення рівнів лізоциму, лактоферину, людського кателіцидину hCap-18/LL-37 та секреторного імуноглобуліну А в ротоглотковому секреті двічі протягом дослідження та після одужання. Як група контролю виступили 36 дітей із неускладненою ГРВІ, референтні значення отримані у 30 клінічно здорових дітей. Результати. У дітей із повторними бактеріальними ускладненнями ГРВІ, на відміну від дітей з епізодичними, була наявна дисфункція природженої місцевої імунної відповіді у вигляді зниження рівнів людського кателіцидину протягом захворювання, лактоферину на ранніх стадіях розвитку бактеріального процесу та лізоциму в усі досліджувані періоди. Характерно, що рівні кателіцидину та лактоферину в обох групах перевищували під час хвороби як контрольні, так і референтні рівні, тоді як вміст лізоциму у дітей ІІ групи був нижчим за рівень здорових дітей як на початку ГСО/ГРС, так і після одужання. Рівні протимікробних пептидів були обернено кореляційно пов’язані з тривалістю симптомів захворювання. У ІІ групі частка невдач при виділенні основного патогену становила близько 35 проти 20 % в І групі (p = 0,008). Також у дітей ІІ групи була нижчою частота виділення пневмококів і гемофіл та вищою — золотистих стафілококів і парагемофільних паличок (асоційована флора). Асоціації двох коагентів були виділені тільки у дітей ІІ групи. Колонізація асоційованою флорою в цілому була пов’язана з низьким рівнем місцевих мукозальних протективних факторів, однак на тлі ГРВІ могла чинити тимчасовий активуючий вплив на локальну імунну відповідь через ланки лізоциму та лактоферину. Висновки. Повторні бактеріальні ускладнення ГРВІ асоційовані з порушеннями місцевого захисту слизових оболонок верхніх дихальних шляхів та з підвищеною частотою колонізації St.aureus і H.рarainfluenzae. Висока частота невдач при виділенні збудника ГСО/ГРС може бути відображенням гіпердіагностики бактеріальних ускладнень через затяжний перебіг захворювання, пов’язаний із локальною імунною дисфункцією та колонізацією асоційованою мікрофлорою. Таким чином, тривалість захворювання не повинна використовуватись як самостійний критерій діагностики бактеріальних ускладнень у цієї групи пацієнтів, оскільки це збільшує ризик діагностичних помилок і необґрунтованої антибіотикотерапії.

show abstract

“…Longitudinal studies profiling the nasopharyngeal microbiota from Australia and Europe suggest that as early as 6 weeks after birth, the nasopharynx is colonised by species of typically skindwelling bacteria, such as Staphylococcus or Corynebacterium (5,17,18). Over time these species are replaced with stable colonisation by Moraxella or Alloiococcus/Dolosigranulum, with transient acquisition of Streptococcus and Haemophilus (5,17,18).…”

Section: Upper Respiratory Microbiotamentioning

confidence: 99%

“…Over time these species are replaced with stable colonisation by Moraxella or Alloiococcus/Dolosigranulum, with transient acquisition of Streptococcus and Haemophilus (5,17,18). Stable profiles such as those dominated…”

Section: Upper Respiratory Microbiotamentioning

confidence: 99%

“…The upper respiratory tract (URT), including the nasal cavity, nasopharynx and oropharynx, is colonised by bacteria almost immediately from birth (16,17). Early life colonisation by specific bacteria may play an important role in respiratory health and disease, with some species associated with number and frequency of ARI and the subsequent development of asthma (5,18,19).…”

Section: Upper Respiratory Microbiotamentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

Viral/bacterial respiratory tract co-infections in children

Brealey¹

View full text Add to dashboard Cite

Respiratory syncytial virus (RSV) is the most significant cause of paediatric acute respiratory infection (ARI). RSV and other respiratory viruses are commonly co-detected with potentially pathogenic bacteria, such as Streptococcus pneumoniae, in the upper airways of young children.While these bacteria are known to be carried asymptomatically, they are also capable of opportunistic infections. Interactions between RSV and S. pneumoniae have been demonstrated in both clinical and molecular studies. However, the clinical significance of these interactions remains debated, and the effect of clinically relevant strain variation in both virus and bacteria on these interactions is also unknown. This work aimed to better understand the role of S. pneumoniae colonisation during RSV infections.To determine the effect of RSV and S. pneumoniae co-detection on disease severity during ARI, molecular pathogen screening of nasopharyngeal samples was conducted in a cohort of young children under the age of two years presenting with ARI at the emergency department of the Royal Brisbane Children's Hospital, Australia. S. pneumoniae was co-detected in approximately 52% of RSV infections, and co-detection was associated with increased disease severity, suggesting that S. pneumoniae plays a pathogenic role in severe paediatric RSV infections.Having established a clinical role for S. pneumoniae during RSV infection, the dynamics of pneumococcal colonisation of the nasal cavity was investigated in the four weeks prior and subsequent to an RSV infection in a longitudinal birth cohort of Brisbane-based children.Approximately 33% of infants and young children with RSV infections were colonised by S. pneumoniae prior to the RSV detection, and strain characterisation of S. pneumoniae in the weeks immediately surrounding the viral infection suggested that any observed growth of S. pneumoniae during RSV infection arose from the pre-existing strain colonising the URT. In another 14% of RSV infections, S. pneumoniae was first detected during the virus infection, suggesting simultaneous acquisition of RSV and S. pneumoniae and possible co-transmission of the two pathogens.The results from the two paediatric cohorts suggested an interaction between RSV and S.pneumoniae that was advantageous to the bacteria. It was therefore hypothesised that the molecular mechanisms governing RSV and S. pneumoniae interactions might be pneumococcal strain-specific and stronger in strains frequently co-detected with RSV. Studies have shown that RSV can increase S. pneumoniae colonisation by enhancing pneumococcal adherence to airway epithelia, and virions iii can bind directly to the bacterium to form co-pathogen complexes. These interactions are in part mediated through the binding interactions between S. pneumoniae surface receptors and the RSV G surface glycoprotein. RSV G is highly variable, both antigenically and genetically, and is the main protein used to type RSV into subtypes A and B. The genetic variation of RSV G was characterised from nasophar...

show abstract

Development of Upper Respiratory Tract Microbiota in Infancy is Affected by Mode of Delivery

Cited by 223 publications

References 34 publications

Differences in the Nasopharyngeal Microbiome During Acute Respiratory Tract Infection With Human Rhinovirus and Respiratory Syncytial Virus in Infancy

Differences in the Nasopharyngeal Microbiome During Acute Respiratory Tract Infection With Human Rhinovirus and Respiratory Syncytial Virus in Infancy

Стан Місцевого Захисту Та Особливості Мікробної Колонізації Слизових Оболонок Верхніх Дихальних Шляхів У Дітей Із Бактеріальними Ускладненнями ГРВІ

Viral/bacterial respiratory tract co-infections in children

Contact Info

Product

Resources

About